基于脉冲耦合神经网络实现细胞分割附Matlab代码

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本文探讨了使用脉冲耦合神经网络(SNN)解决生物医学图像处理中的细胞分割问题。通过介绍 DIC-C2DH-HeLa 数据集,展示了一个基于类似U-Net架构的SNN模型的构建过程,并提供了Matlab代码示例,用于图像预处理、网络构建、训练和预测。文章强调了这仅作为基本示例,实际应用中可进行优化和自定义。
摘要由CSDN通过智能技术生成

基于脉冲耦合神经网络实现细胞分割附Matlab代码

细胞分割是生物医学领域中常见的一个问题,它是指将图像中的细胞进行区分和分离。在图像处理中,细胞分割一直是一个具有挑战性的问题。本文将介绍如何使用脉冲耦合神经网络(Spiking Neural Network,SNN)来实现细胞分割,并提供相应的Matlab源代码。

首先,我们需要准备一个包含细胞图像的数据集。在本文中,我们使用公共数据集DIC-C2DH-HeLa,这个数据集包含400多张2D图像,每张图像都包含单个或多个人类细胞。

代码的第一部分是数据准备。我们需要读取所有图像,将它们转换为灰度图像,并将它们存储在一个单独的文件夹中。

dataDir = 'data/DIC-C2DH-HeLa';
outputDir = 'results';

imageFiles = dir(fullfile(dataDir, '*', '*ch1.tif'));
numImages = numel(imageFiles);

for i = 1:numImages
    % Load image
    image = imread(fullfile(imageFiles(i).folder, imageFiles(i).name));

    % Convert to grayscale
    if size(image, 3) == 3
      
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