医学图像DICOM文件解析——DICOM内部信息详解篇

一、医学影像学介绍

   医学影像学Medical Imaging，是研究借助于某种介质（如X射线、电磁场、超声波等）与人体相互作用，把人体内部组织器官结构、密度以影像方式表现出来，供诊断医师根据影像提供的信息进行判断，从而对人体健康状况进行评价的一门科学，包括医学成像系统和医学图像处理两方面相对独立的研究方向。
   仪器主要包括X光成像仪器、CT(普通CT、螺旋CT）、正子扫描(PET)、超声（分B超、彩色多普勒超声、心脏彩超、三维彩超）、核磁共振成像（MRI）、心电图仪器、脑电图仪器等。

二、DICOM文件简介

  DICOM（Digital Imaging and Communications in Medicine） 即医学数字成像和通信，是医学图像和相关信息的国际标准（ISO 12052）。DICOM被广泛应用于放射医疗，心血管成像以及放射诊疗诊断设备（X射线，CT，核磁共振，超声等），并且在眼科和牙科等其它医学领域得到越来越深入广泛的应用。所有患者的医学图像都以 DICOM 文件格式进行存储。这个格式包含关于患者的PHI（protected health information）信息，例如姓名，性别，年龄，以及其他图像相关信息比如捕获并生成图像的设备信息，医疗的一些上下文相关信息等。医学图像设备生成 DICOM 文件，医生使用 DICOM 阅读器（能够显示 DICOM 图像的计算机软件）阅读并对图像中发现的问题进行诊断。

  目前采用的标准是DICOM3.0，每一张图像中都携带着大量的信息，这些信息具体可以分为以下四类：（a）Patient（b）Study（c）Series（d）Image。每一个DICOM Tag都是由两个十六进制数的组合来确定的，分别为Group和Element。如(0010,0010)这个Tag表示的是Patient’s Name，它存储着这张DICOM图像的患者姓名。

  基于C++的DCMTK、基于Java的dcm4che以及基于python的pydicom，都是非常优秀的解释DICOM标准的第三方库，通过在工程中引入它们可以避免软件开发人员去进行底层的解析工作，可为项目开发提高效率。

  目前例如CT，核磁共振，超声等利用精确准直的X线束、γ射线、超声波等，与灵敏度极高的探测器一同围绕人体的某一部位作一个接一个的断面扫描，所以扫描后得到的图像是多层的图像，而我们把一层层的图像在z轴上堆叠起来就可以形成三维图像(这就涉及到三维重建的问题)，这时，每一层的图像我们都可以存在dicom文件中（当然，dicom文件不是单纯的像素信息，它还有很多的数据头部信息），如下图，我们的目的就是要把在这些数据头部信息和像素信息从一系列dicom文件中读取出来。

   DICOM文件是指按照DICOM标准而存储的医学文件，一般由一个DICOM文件头和一个DICOM数据集合组成，结构图如下图：

DICOM文件头包含了标识数据集合的相关信息，每个DICOM文件都必须包括一个文件头：

• 文件前言，由128个字节组成；
• DICOM前缀，可根据这长为4个字节的字符串是否等于“DICM”来判断该文件是不是DICOM文件；
• 文件信息元素

三、DICOM内部信息详解(DICOM Tag与VR)

   DICOM数据集是DICOM文件的主要组成部分，其由DICOM数据元素按照指定的顺序排列。数据元素最基本的数据单元是数据元，按照TAG从小到大顺序排列，即一个数据元表示一个TAG。数据元主要由4个部分组成：

• TAG号：由4个字节组成，包括2字节的组号和2字节的元素号（例如：0010 0040 表示患者性别，其中的组号：0002描述设备通讯信息、0008描述特征参数、0010描述患者信息、0028描述图像信息参数）。需要的DICOM文件相关数据时，就是根据TAG来获取。
• 值表示(VR，value representation)：由两个字节的字符组成，存储描述该项数据元信息的数据类型，包含例如：LO（Long String，长字符串）、IS（Interger String，整型字符串），DA（data，日期）等等共27种数据类型。
• 值长度(value length)：存储描述该项信息的数据长度。
• 值域(value)：存储描述该项信息的数据值。

   其中数据元信息可以根据信息的不同，分为4类：-Patient-Study-Series-Image-。可以理解为一个患者（patient）可以做多次检查（study），一次检查包含多个检查部位（series），而每个检查部位都有一张或多张相应的影像图像（image）。

1.常见的TAG

(1) Patient Tag

Group	Element	Tag Description	中文解释	数据类型(VR)
0010	0010	Patient’s Name	患者姓名	PN
0010	0020	Patient ID	患者ID	LO
0010	0030	Patient’s Birth Date	患者出生日期	DA
0010	0032	Patient’s Birth Time	患者出生时间	TM
0010	0040	Patient’s Sex	患者性别	CS
0010	1030	Patient’s Weight	患者体重	DS
0010	21C0	Pregnancy Status	怀孕状态	US

(2) Study Tag

Group	Element	Tag Description	中文解释