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原创 Paper阅读笔记

文献阅读笔记

2022-06-28 09:22:17 181

原创 Git常见命令(持续更新)

# Gitee/Github用Git创建以及上传git config --global user.name ' Github用户名 ' # 设置用户名git config --global user.email "[email protected]" # 设置用户邮箱git init # 初始化 git status #

2022-04-25 11:55:24 163

原创 汇总

个人所有博客汇总!!!

2021-10-06 15:29:19 792

原创 Ubuntu系统命令笔记(持续更新中)

1.ubuntu的nvidia驱动安装:nvcc -V #查看系统是否已经有驱动,cuda等ubuntu-drivers devices # 查看系统适合的驱动版本sudo ubuntu-drivers autoinstall # 自动下载对应的版本sudo dpkg --list | grep nvidia-* # 查看系统显卡的版本cd /usr/srcls # 获取自动安装的显卡驱动详细版本,如430.63.01sudo apt-get install d

2021-09-29 21:33:46 906

原创 Python常用命令整理

1.管理Conda(1)检查conda版本conda --version(2)升级当前版本condaconda update conda2.管理(虚拟)环境(1)创建环境# 创建一个名为python3的环境,指定Python版本是3.8(不用管是3.8.x,conda会为我们自动寻找3.8.x中的最新版本)conda create --name python3 python=3.8# 安装好后,使用activate激活某个环境activate python3 # for Windows

2020-10-24 23:26:50 920

原创 分割模型nnUNet学习日记(四):汇总

参考:

2023-07-14 23:31:56 565

原创 我的创作纪念日

还记得 2019 年 07 月 07 日,当时在参加一个比赛需要用到云服务器,由于第一次接触所以在网上找了很多云服务器的注册和配置教程,但是发现很多分享都写的不够全面,于是萌生了把整个配置过程撰写成一篇博客分享出来的想法。自此我的第 1 篇技术博客:《滴滴云服务器的注册与快速配置教程》诞生了,而也正是从那开始,我开始了我的分享之旅。在创作的过程我认为最大的收获便是培养了自己对知识的梳理和归纳能力,同时将博客作为的平时的随记,也方便了后期的查看。希望未来能够继续保持创作的热情与动力。

2023-07-08 23:12:39 304

转载 利用集成方式来提高任意给定的神经网络性能

https://cloud.tencent.com/developer/article/1160636

2023-05-24 20:56:02 571

原创 Python、VTK和QTdesigner的联合使用

Python、VTK和QTdesigner的联合使用

2023-03-16 17:33:53 704

原创 Pytorch的hook技术——获取预训练/已训练好模型的特定中间层输出

Pytorch的hook技术——获取预训练/已训练好模型的特定中间层输出

2023-02-08 23:13:29 2027

原创 医学图像包——DCMTK、VTK、ITK、RTK、SimpleITK

医学图像包——DCMTK、VTK、ITK、RTK、SimpleITK

2022-12-28 14:19:00 3023

原创 基于稀疏表达的图像融合相关知识

基于稀疏表达的图像融合相关知识

2022-12-04 16:31:21 260

原创 VS Code常用操作

VS Code常用操作

2022-11-09 23:14:27 1300

原创 VS Code配置matlab

IDE VS Code配置matlab

2022-11-09 16:57:58 6566 18

原创 医学图像DICOM文件解析——DICOM内部信息详解篇

DICOM文件内部信息详解

2022-11-08 20:32:16 18171

原创 医学图像DICOM文件解析——RT Structure篇

医学图像DICOM头文件解析——RT Structure篇

2022-11-07 23:50:08 2417 4

原创 【对比学习】CUT模型论文解读与NCE loss代码解析

对比学习模型CUT论文解读,NCE loss代码详解

2022-11-04 11:41:23 3592 11

原创 图神经网络GNN学习日志——GNN介绍

图神经网络

2022-10-23 21:58:45 2474

原创 网络结构可视化——Torch-summary库

网络结构可视化

2022-10-15 00:02:02 3817

原创 深度学习验证指标计算Torchmetrics包

深度学习验证指标计算Torchmetrics包

2022-09-30 20:49:29 615

原创 检测任务评估指标AP和AR

检测任务评估指标

2022-09-22 14:17:39 3171

转载 深度学习模型大小与模型推理速度的深度探讨

深度学习模型大小与模型推理速度的深度探讨

2022-09-19 22:49:07 1165

原创 pytorch之DDP分布式训练技巧实战和混合精度训练

[PyTorch] DDP分布式训练技巧实战和混合精度训练

2022-07-08 15:59:47 696

原创 医学影像数据格式nii到dicom互转方法汇总

Github:https://github.com/wanderine/nnunetdocker/blob/master/convert_to_RTSTRUCT.py

2022-07-07 23:29:08 2972

原创 分割模型nnUNet学习日记(三):nnUNet参数batch_size和patch_size的修改方式

分割模型nnUNet学习日记(三):nnUNet参数batch_size和patch_size的修改方式

2022-07-03 20:35:53 4537 3

原创 分割模型nnUNet学习日记(一):在Ubuntu系统下如何快速使用nnUNet跑通自己的数据

分割模型nnUNet学习日记(一):在Ubuntu系统下如何快速使用nnUNet跑通自己的数据

2022-07-02 18:45:15 4429 3

原创 分割模型nnUNet学习日记(二):常见问题报错解决方案

分割模型nnUNet学习日记(二):常见问题报错解决方案

2022-07-02 17:44:10 1095

原创 Python中SimpleITK库的常用函数

在医学图像上经常使用的一个Python库SimpleITK,下面介绍其常用的函数:

2022-06-07 14:05:50 4709 2

原创 使用opencv实现16位图转8位图

最近在处理一批.tif格式的数据,但是由于设备导出的数据是16位图,因此一般图片查看器打开都是一片黑。采用opencv实现16位tif图转换成8位图

2022-06-02 21:25:41 3965 5

原创 PyQT大法

学习网站:https://www.byhy.net/tut/py/gui/qt_01/;https://www.bilibili.com/video/BV1cJ411R7bP.PyQT配置:https://blog.csdn.net/liupeng19970119/article/details/104281766;https://blog.csdn.net/weixin_44593822/article/details/112199746.QT designer:https://blog.c

2022-05-10 20:16:17 206

原创 Win10多用户同时远程桌面,并各自操作互不干扰

微软Server版操作系统默认是支持多用户登陆的,例如Windows Server 2012,而Win10操作系统正常情况下是不允许用户同时远程的,即一个用户远程进来会把另一个用户踢掉,因此需要破解才能使得多个用户同时登陆远程桌面。也即需要安装一个破解补丁,根据RDPWrap补丁的原理,简单来说就是:修改termsrv.dll和termsrv.dll.mui这两个远程服务文件,达到多用户远程登陆的目的。可以把其它操作系统上的termsrv.dll和termsrv.dll.mui这两个文件提取出来,然后替换本

2022-03-06 00:13:06 36383 4

原创 影像基础-----CT-MRI图像的特点和临床应用

CT图像的特点1.CT图像是数字化模拟灰度图像CT图像是经数字转换的重建模拟图像,是由一定数目从黑到白不同灰度的像素按固有矩阵排列而成。这些像素的灰度反映的是相应体素的X线吸收系数。如同X线图像,CT图像亦是用灰度反映器官和组织对X线的吸收程度。其中黑影表示低吸收区,即低密度区,如含气的肺组织;灰影表示中等吸收区,即中等密度区,如软组织的肌肉或脏器;白影表示高吸收区,即高密度区,如含钙量高的骨组织。2.CT图像具有高的密度分辨力与传统X线图像不同,CT图像的密度分辨力高,相当于传统X线图像的10~

2022-02-21 22:54:31 8771

原创 【Python】实现图片切成patch,以及有间隙的拼接代码

图片的切分import os.pathfrom PIL import Imageimport sysimport torchvision.transforms as transforms# 图片的切块def cut_image(image, patch_num): width, height = image.size item_width = int(width / patch_num) box_list = [] # (left, upper, right,

2022-02-20 15:08:23 3238 11

原创 深度学习3D可视化工具——Zetane Engine

神经网络在工作的时候,里面到底是什么样?为了能透视这个“AI黑箱”中的过程,加拿大蒙特利尔一家公司开发一个3D可视化工具Zetane Engine。只需要上传一个模型,Zetane Engine就可以巡视整个神经网络,并且还可以放大网络中的任何一层,显示特征图,看清流水线上的每一步。目前Zetane Engine不同系统的版本都可以在GitHub网站zetane中找到,不同版本的下载地址(左图为卷积层的特征图,右图为特征图的3D可视化)可视化AI工作流程首先,我们需要上传一个模型,上

2022-02-19 20:36:37 8469 13

原创 Python将模型参数文件(.pth/.pkl等)转换为ONNX格式

import torchimport pickleimport numpy as npmodel_path = r'./sVGG16.pkl' # 模型参数路径 dummy_input = torch.randn(1, 3, 256, 256) # 先随机一个模型输入的数据model = sVGG16() # 定义模型结构,此处是我自己设计的模型checkpoing = torch.lo

2022-02-19 16:56:38 3679 2

原创 【分类模型评价】宏平均(macro avg)、微平均(micro avg)和加权平均(weighted avg)

当我们使用 sklearn.metric.classification_report 工具对模型的测试结果进行评价时,会输出如下结果:对于 精准率(precision )、召回率(recall)、f1-score,他们的计算方法很多地方都有介绍,这里主要讲一下micro avg、macro avg 和weighted avg 他们的计算方式。1、宏平均 macro avg:对每个类别的 精准、召回和F1 加和求平均。精准macro avg=(P_no+P_yes) / 2=(0.24+0.73)

2022-02-14 11:28:04 17384 2

原创 医学图像特征激活图可视化库MedCAM

官网:https://meclabtuda.github.io/M3d-Cam/medcam/medcam_inject.htmlGithub网址:https://github.com/MECLabTUDA/M3d-Cam安装可直运行:pip install medcam# 或者conda install -c conda-forge medcam例子代码:# Import M3d-CAMfrom medcam import medcam# Init your model and da

2022-01-23 22:10:10 1520

转载 Ubuntu解决根分区满了进不去系统的解决方案

参考博客:linux 磁盘空间满了,排查记录关于linux磁盘莫名满的问题

2022-01-20 21:37:48 1389

原创 3D Slicer——配准篇(基于ANTs工具)详细教程

ANTs配准工具是配准是常用的工具之一,本篇主要讲基于3D slicer的ANTs配准基于Python的ANTs工具实现的配准和入门可见:医学图像配准工具ANTs的配置和入门相关函数的学习介绍可见:医学图像配准工具ANTs的学习——相关函数以及参数介绍1. 首先在插件扩展管理搜索‘SlicerANTs’,并安装2. 安装成功后在此便能看到 ANTs 选项3. 导入图像选择移动和固定图像,并选择配准方式4. 点击后开始配准...

2022-01-17 21:45:44 6039 10

原创 解决Ubuntu命令“sudo apt-get install”——“ E: 无法定位软件包”问题

1. 添加镜像源 (本文是清华源)。运行代码:sudo vim /etc/apt/sources.list添加如下内容:deb https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic main restricted universe multiverse# deb-src https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/ubuntu/ bionic main restricted universe multiversed

2022-01-17 15:22:25 3352

Win10多用户操作以及Win10家庭版远程桌面问题最新补丁

可实现Win10多用户操作,以及解决Win10家庭版远程桌面问题

2023-02-16

放疗计划matlab工具包matrad

放疗计划设计,逆向优化matlab工具包matrad

2022-12-27

DICOM查看器dicompyler安装包

查看DICOM头文件信息,包括RT structure、RTPlan、RDose文件

2022-11-07

dicompyler使用的DICOM / DICOM RT的核心放射治疗Python模块库

dicompyler使用的DICOM / DICOM RT的核心放射治疗Python模块库

2022-11-07

官方分割模型nnUnet的github仓库项目

官方分割模型nnUnet的github仓库项目

2022-07-01

配准ANTs工具的官方介绍文档

配准ANTs工具的官方介绍文档

2022-05-26

Win10多用户操作最新补丁

Win10多用户操作最新RDPWrap补丁

2022-03-05

深度学习的3D可视化工具Zetane——windows版本

深度学习的3D可视化工具Zetane——windows版本

2022-02-19

深度学习的3D可视化工具Zetane——Linux版本

深度学习的3D可视化工具Zetane——Linux版本

2022-02-19

显著性Map—相关代码.zip

深度学习常见显著性Map代码示例

2021-08-27

PyTorch学习日志.zip

深度学习框架Pytorch学习文件以及思维导图,包括数据增强、模型构建、模型可视化tensorboardX等(包含学习代码)

2021-07-23

Elastix安装包与代码

配准工具Elastix程序安装包和github代码

2021-01-07

elastix-5.0.1-manual.pdf

配准软件Elastix学习文档

2020-12-22

surface-distance-master.zip

图像分割评估指标——表面距离计算库: 这个库主要包含了以下几个表面距离计算: Average surface distance 平均表面距离 Hausdorff distance 豪斯多夫距离 Surface overlap 表面重叠度 Surface dice 表面dice值 Volumetric dice 三维dice值

2020-08-17

图形库graphviz-V2.38.msi.rar

跨平台的图形库graphviz安装包,可用于提供方便的树图等导出,官网下载比较慢,上传一个备用。

2020-02-13

无线充电.rar

无线电动小车设计报告两篇,包含代码

2019-08-08

一种基于CT图像的肝肿瘤组合分割法_陈亮亮

本论文讲的是:一种基于CT图像的肝肿瘤组合分割法,对CT图像分割有一定价值

2019-04-08

机器学习:实用案例解析

本书籍主要针对机器学习的新手,书里有大量机器学习的实用案例解析

2019-04-08

《机器学习实战基于Scikit-Learn和TensorFlow》

《机器学习实战基于Scikit-Learn和TensorFlow》

2019-04-08

空空如也

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