一、赛事背景
赛题名称:天然产物的靶点活性预测
本赛题旨在通过整合数智技术和生物技术,推动天然产物药物发现。参赛者将使用人工智能和计算生物学来预测天然药物分子与免疫细胞靶点的结合亲和力和选择性,开发评估这些相互作用的工作流程或算法。礼达先导将提供实验支持,利用基于探针的自动化药物靶点蛋白质组学平台验证预测结果。
二、赛题内容
本大赛由支持单位礼达先导发起,并为参赛团队提供免费的实验支持,利用基于靶点探针的自动化药物靶点蛋白组学平台,结合“湿”实验技术,评估“干”实验技术预测的分子在活细胞层面与免疫细胞靶点组的结合数据。大赛使用的天然产物由陶术生物提供。
实验支持
靶点识别过程涉及多个实验步骤和数据分析:
药物孵育:天然药物分子与免疫细胞共同孵育。药物被细胞摄取并特异性地富集于其相互作用的靶点附近。高亲和力的药物与靶点蛋白形成稳定的相互作用。
标记与富集:药物与靶点相互作用后,使用多靶点探针对靶点蛋白进行共价标记。通过检测多个蛋白标记的强度变化,可以识别该配体的靶点蛋白组。
样品处理:孵育后的细胞经过裂解、蛋白沉淀、酶解、标记和富集等步骤,得到带探针修饰的肽段样品。
质谱分析:使用串联质谱仪(如Orbitrap Fusion Lumos/Orbitrap Fusion Eclipse)对样品进行检测,应用TMT-SPS-MS3等方法获取带探针修饰肽段的定量结果。
数据处理:通过数据处理,识别出DMSO组与药物组比例显著变化的蛋白,这些蛋白即为药物的结合靶点蛋白。
实验流程示例
实验结果示例
三、参赛资格
1、参赛人员须为高校全日制在校本科生、硕士生或博士生,在校生身份以大赛通知正式发布之日为准。
2、每个参赛项目团队人数不得超过10人,其中来自同一所高校的人数不得超过5人。每人只能参加1个创新赛道参赛项目团队。
3、每个参赛项目可聘请1-2名指导老师,指导老师须为联盟成员单位正式在职教师。如参赛队伍成员均来自非联盟成员单位,须自行联络并聘请联盟成员单位的指导老师。
4、报名完成后,参赛团队负责人、成员及指导老师均不得变更。
5、比赛过程中,一旦发现提交的材料存在虚假、抄袭或者侵犯他人知识产权,将被取消参赛资格。
6、大赛主办和技术支持单位中涉及题目编写、数据接触的人员及其近亲属禁止参赛。
四、赛程安排
1、报名
报名开始:2024年6月27日
报名结束:2024年8月31日
2、初赛
初赛提交开始:2024年7月31日
初赛提交结束:2024年9月10日
3、复赛
复赛提交开始:2024年9月15日
复赛提交结束:2024年10月15日
4、决赛
2024年10月下旬,具体时间另行通知
5、颁奖
2024年11月初进行颁奖
颁奖仪式将在中国北京举办,具体时间和形式另行通知
赛程安排所提到的时间均为北京时间。大赛组委会保留必要时更新比赛赛制及时间表的权利。
五、评选标准
1、提交规则
比赛期间不限提交次数,赛事组仅以提交截止日期前的最后一次提交打分。
2、初赛
任务说明:参赛团队需在提供的靶点数据集范围内,对70个指定的天然产物分子的靶点亲和力进行预测。针对每个天然产物分子,推荐20个最可能有结合能力的靶点。
评审标准:每个天然产物分子的推荐靶点中,至少有一个靶点是实验验证中证实有结合能力的靶点,则该分子得1分,最高分为70分。初赛得分前30名的队伍将进入复赛。
3、复赛
任务说明:参赛团队需在提供的靶点数据集范围内,对100个指定的天然产物分子的靶点亲和力进行预测。针对每个天然产物分子,推荐20个最可能有结合能力的靶点。
评审标准:每个天然产物分子的推荐靶点中,每有一个靶点是实验验证中证实有结合能力的靶点得1分,每个分子不超过5分,最高分为500分。复赛得分前10名的队伍将晋级决赛答辩。
4、决赛
任务说明:决赛将视情况以线下或线上答辩的形式进行;
评审标准:决赛成绩将按照复赛成绩70%、答辩表现30%评定,答辩评审规则请关注后续官网更新与通知。决赛答辩后,本次比赛的各个获奖团队将得到组委会及协作单位的正式表彰。
六、奖项设置
本赛道奖金如下(金额为税前金额,以人民币计):
金奖1个,奖金10万元/个;
银奖1-3个,奖金3万元/个;
铜奖3-5个,奖金1万元/个;
优胜奖6-10个,奖金2000元/个
七、知识产权
1. 本大赛提供的赛题数据仅限用于比赛本身,不得在比赛范围外使用或对外传播。
2. 比赛过程中产生数据(包含湿实验数据)归主办方所有。
3. 比赛过程中,选手所使用的算法、工作流程等的知识产权都归属开发者所有。
报名注册即代表认同主办方以上声明。
八、提交方式
请将所有提交文件压缩为一个“.zip”文件,并命名为“submission.zip”。选手无需在压缩文件命名中添加队伍名、提交版本、提交时间等信息,平台会自行识别。压缩包内应包含:
预测结果:每个队伍需提交一个Excel表格,每行为一个天然产物分子,及预测具有活性的靶点名称。平台将自动校验 Excel 的格式,如不符合格式要求则提交失败,选手可重新提交。
Excel格式
方法报告:除预测结果外,每轮提交选手需要额外提交一份pdf 报告,介绍和总结预测所使用的工作流程和方法。报告不做格式要求,但不包含方法报告的提交为无效提交。
九、报名咨询
报名网站:
https://diidea.pku.edu.cn/competition/(复制至网页打开)
报名咨询:孔寅飞 01062752509
综合事务:diidea@163.com
创新赛道生命科学组:diidea_lifesci@163.com