R语言 某高校的期末综合测评

最新推荐文章于 2024-08-13 00:48:08 发布
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分类专栏： R语言大学作业 文章标签： r语言 开发语言
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本文利用R语言对一个包含437个观测和3136个基因的diffmRNAExp.txt文件进行分析。首先，通过处理行名，将数据转换并命名为mydata02。接着，通过逻辑判断确定正常样本和癌症样本，并转置数据得到mydata03。然后，随机抽取10个基因进行探索性分析，包括统计图形、相关性、回归分析和异常点检测。在回归分析中，发现部分基因间的相关性较小，且存在一些不合理模型。最后，通过聚类分析比较了层次聚类和K均值聚类的效果，发现K均值聚类在区分正常和癌症样本时表现更优。
摘要由CSDN通过智能技术生成

期末综合测评
diffmRNAExp.txt文件记录了正常人（字符串第14和第15个位置组合成的数值大于10的观测点，例如，TCGA-AA-3522-11A-01R-A32Z-07）与结肠癌患者（字符串第14和第15个位置组合成的数值小于10的观测点，例如，TCGA-AA-3522-11A-01R-A32Z-07）的基因表达文件。该文件包含437个观测及3136个基因。
首先需要做一些准备工作。
1.读入数据


mydata01<- read.table(file = "diffmRNAExp.txt", header = T, row.names = 1, sep =
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