超详细的ROC曲线绘制教程

本文是一篇关于如何使用R中的pROC包绘制ROC曲线的教程,包括加载数据、拟合曲线、绘制多条ROC曲线以及通过plot()函数进行详细定制,如调整坐标轴、设置曲线颜色和线型、显示AUC数值等。
摘要由CSDN通过智能技术生成

ROC曲线是临床中常用的统计分析之一,R中可以绘制ROC曲线的包也有很多,pROC包就是其中的佼佼者。

pROC包可以计算AUC和95%置信区间,可以可视化、平滑和比较ROC曲线。下面是pROC包中的常用缩写

缩写 解释
ROC曲线 受试者操作特征曲线
AUC ROC曲线下面积
pAUC 部分ROC曲线下面积
CI 置信区间
SP 特异度specificity
SE

灵敏度sensitivity

1. 加载数据

使用pROC包自带的aSAH数据集来演示。该数据集包括了113例动脉瘤蛛网膜下腔出血患者的临床和实验室资料。

library(pROC) # 加载pROC包
data(aSAH)   # 加载内置数据集
head(aSAH)   # 查看数据集

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