使用 R 和 ggraph 自定义树状图

最新推荐文章于 2023-11-22 09:31:28 发布
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分类专栏： R语言大学作业 文章标签： r语言 开发语言
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本文链接：https://blog.csdn.net/Mrrunsen/article/details/126521268
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本文介绍了如何使用R语言的igraph和ggraph包创建并自定义树状图。通过设置layout参数，可以选择线性或循环展示树形结构。同时，文章讲解了如何使用geom_edge_link和geom_edge_diagonal来定制边的样式，并通过添加颜色和形状来增强数据的可视化效果，使得树状图的组织结构更加清晰。整个过程类似于ggplot2的使用方式。
摘要由CSDN通过智能技术生成

首先使用igraph包创建数据集和图形对象。

# Libraries
library(ggraph)
library(igraph)
library(tidyverse)
theme_set(theme_void()
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r包调用legend函数_R网络数据可视化（3）ggraph：ggplot2的网络可视化
weixin_34675606的博客
12-17 1110
（本文首发于个人公众号“数据与平行世界”，欢迎关注！）（教程略长，可直接看文末函数总结）3.1 ggraph简介：ggplot2+tidygraphggplot2包是R中最知名的可视化方式，它提供了结构化的图形语法。在ggplot2中，可以从各种从各种可视化构建块中进行选择，并将它们逐个添加到图形中，一次添加一层。ggplot2本身并没有提供直接进行网络可视化的工具，但是利用图形语法的思想，可以在...
R 数据可视化 —— ggraph 图形创建与布局
dxs18459111694的博客
11-21 761
在前面几节，我们对igraph进行了一些简单介绍。接下来我们要介绍的是ggraph包的使用通常，ggraph会和tidygraph一起搭配使用，这两个包都是写的。tidygraph提供了一系列tidyAPI用于操作图，通常可以将图对象设计为两个tidy表，一个用于表示node数据，另一个用于表示edge数据。还提供了一些额外的动词用于操作这两个表，同时也提供了很多的图论算法，让图形对象的处理看起来更像是在处理数据框。ggraph是ggplot2的扩展，用于绘制关系型数据结构，如网络、图和树等。
R语言ggraph包绘制环状网络图
qq_27390023的博客
07-07 6467
ggraph 是 ggplot2 的扩展，用于绘制关系型数据结构，如网络、图和树等。 ggraph 包含 3 个核心概念： layout：定义图的布局，如蜂巢图、圆堆积图等 nodes：定义节点图形属性，使用 geom_node_*() 函数来控制 edges：定义边的图形属性，使用 geom_edge_*() 函数来控制 参考 https://www.e-learn.cn/tag/ggraph......
Anaconda 环境下 R 包 ggraph_1.0.2 安装小记
BioIT爱好者
09-27 440
...
roc图 r语言_酷炫树状图 R语言
weixin_42513269的博客
12-08 437
树状图主要用于展示较多二级变量，相较于表，它更具简洁，常用于基因，RNA，临床指标的展示。上代码：install.packages("ggraph")library(ggraph)install.packages("igraph")library(igraph)myedges显示前2行数据(大家可以参考处理表格数据)：name value group1 total 10.000000 2 A 2...
使用R语言igraph和ggraph包绘制基因相互作用网络图
09-07
本文展示了如何使用R语言中的igraph和ggraph包来绘制和可视化基因相互作用网络图。igraph包提供了强大的图形处理功能，能够创建和操作复杂的网络结构，而ggraph包则提供了更加美观和灵活的图形布局和可视化选项。 ...
使用R语言绘制树状图和网络图
# 1. 介绍 ## 1.1 什么是树状图和网络图 树状图（Tree diagram）是一种数据结构图，用来...利用R语言的各种包和库，可以轻松绘制各类图表，包括树状图和网络图。 ## 1.3 本文的主要内容及目的 本文将介绍如何使用R
R 数据可视化 —— ggraph 边与节点
dxs18459111694的博客
11-22 477
将网络图结构与我们平常绘制的数据图进行对比，我们可以发现，图的布局就相当于每个数据点的坐标，而节点就相当于数据点，边就是连接数据点的几何图形，可以是直线、曲线或带箭头的线等。所以，不同的节点形状和不同的边形状进行组合，就绘制出了上节我们展示的各式各样的图形。下面，我们要介绍节点与边的相关操作，图结构如下。
R 绘制环形树状图
weixin_43718786的博客
08-21 1489
按大类小类的从属关系绘制环形图，并把不同值的节点设置为相应大小。要求同一类的节点应为同一颜色。 按照输入，处理代码和输出记录
python 线性回归 统计检验 p值_医学统计与R语言：样本方差的抽样分布
weixin_39875760的博客
11-09 953
微信公众号：医学统计与R语言如果你觉得对你有帮助，欢迎转发输入1： rdata=matrix(rnorm(1000*6,0,3),6)rvar=apply(rdata,2,var)mean(rvar)结果1： [1]8输入2： var(rvar)结果2： [1]32=2*81/5输入3： library(ggplot2)p1<-ggplot(data...
R语言igraph软件包方法
ronghuilin的博客
11-07 2万+
R语言图数据结构的实现.igraph软件包建立图或网络个数数据的方法，图的可视化。
ggraph包优雅的绘制网络图
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01-30 1194
本节来介绍如何基于微生物测序得到的OTU表绘制一个物种间网络图，下面通过一个小栗子来进行展示 ❞ 加载并安装R包 package.list=c("tidyverse","ggraph","tidygraph","magrittr","tidytext","widyr") for(packageinpackage.list){ if(!require(package,character.only=T,quietly=T)){ install.packages(package...
交互式弦图的绘制(R实现)
Christina
11-29 2181
子啊和弦图绘制方面，除了基础包之外还有ggplot版本的ggraph，这里其实还有交互的和弦图的绘制方法，例如，edgebundleR包，成图效果如下所示: require(igraph) ws_graph = watts.strogatz.game(1, 50, 4, 0.05) edgebundle(ws_graph,tension = 0.1,fontsize = 20) 之前google到一份图，ggplot的图层和设置参数，认为十分完正，可视化出来也是很有创意，这里给大家链接和图片.
[R语言] 基于R语言实现树形图的绘制
You and Me
09-05 1万+
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用R语言中的igraph包解决图与网络的问题并对其进行可视化
Mac版R语言入门（6）：R语言图形绘制函数与高级可视化方法
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06-23 3438
  R语言问题讨论交流，欢迎关注我的新浪微博：Jenny爱学习微信公众号：R语言数据分析与实践   本篇整理了较为全面的R语言绘图函数和可视化支持包，涵盖了金融、测绘、空间数据、教学等领域的可视化图表绘制方法。 R语言作为顶级的可视化编程语言，以其出色的绘图功能闻名于统计图届。 画图命令可以被分成三种基本类型： （1）高级绘图函数：把数据作为函数的参数来产生一个图形。所有图中标签均由函...
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1.数据导入 以下R包主要用于数据导入和保存数据： feather：一种快速，轻量级的文件格式；在R和python上都可使用 readr：实现表格数据的快速导入 readxl：读取Microsoft Excel电子表格数据 openxlsx：读取Microsoft Excel电子表格数据 googlesheets：读取google电子表格数据 haven：读取SAS，SPSS和Sta...
R语言使用igraph包绘制网络图
CinboWang的博客
12-17 5291
效果如下 library(igraph) # Create data set.seed(1) data <- matrix(sample(0:1, 100, replace=TRUE, prob=c(0.8,0.2)), nc=10) network <- graph_from_adjacency_matrix(data , mode='undirected', diag=F ) # Default network par(mar=c(0,0,0,0)) opar <- par(no
R语言常用packages（常用R包）
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Nicolelovesmath的博客
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R语言 读取csv文件，使用ggpairs()函数绘制相关性热力图，
最新发布
09-18
R语言是一种流行的统计分析和图形编程语言，常用于数据科学领域。如果你想要使用R语言读取CSV文件并生成相关性热力图，可以按照以下步骤操作： 1. 首先，你需要安装`readr`包，它提供了一个快速、易用的CSV文件读取功能。如果还没安装，可以在命令行输入： ``` install.packages("readr") ``` 2. 然后加载`readr`和`GGally`（或`ggraph`和`tidyverse`组合），这两个库分别用于读取数据和创建热力图： ```R library(readr) library(GGally) # 或者 library(ggraph), library(tidyverse) ``` 3. 使用`read_csv()`函数从CSV文件中读取数据： ```R data <- read_csv("yourfile.csv") # 将"yourfile.csv"替换为你的CSV文件路径 ``` 4. 接下来，你可以利用`ggpairs()`函数，这个函数来自`GGally`包，它能够绘制数据集中各变量之间的相关性热力图。确保你的数据是一个data.frame或tibble： ```R ggpairs(data) ``` 5. `ggpairs()`会自动计算并显示数值型变量之间的皮尔逊相关系数，颜色深浅表示相关性强弱。
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