r包调用legend函数_R网络数据可视化（3）ggraph：ggplot2的网络可视化

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（教程略长，可直接看文末函数总结）

3.1 ggraph简介：ggplot2+tidygraph

ggplot2包是R中最知名的可视化方式，它提供了结构化的图形语法。在ggplot2中，可以从各种从各种可视化构建块中进行选择，并将它们逐个添加到图形中，一次添加一层。ggplot2本身并没有提供直接进行网络可视化的工具，但是利用图形语法的思想，可以在ggplot2基础上扩展开发。

ggraph是建立在ggplot2一个扩展R包，它的目标是为网络、树和系统树等等表示关系与层次的数据结构进行可视化。ggraph继承了ggplot2的图形语法，建立了面向节点和边的新的图形对象（geom），并添加了布局的概念。这样就可以在ggplot2框架下进行更加灵活美观的网络可视化。

同时，ggraph采用tidygraph包作为数据结构和网络分析的引擎。tidygraph是对传统的igraph包的打包和扩展，目的是在R的tidyverse语法框架下进行网络数据分析。

ggraph使用tidygraph提供的tbl_graph类对象作为图形表示的数据结构，因此它可以直接支持tidygraph支持的每个对象，包括data.tree、phylo和graph等等，还可以通过as_tbl_graph()支持其他网络可视化包提供的数据对象，如igraph（igraph包）、dendrogram(stats包)、hclust（stats包）和network（network包）。不仅如此，ggraph还可以直接调用tidygraph的网络布局和网络分析算法。

建立在ggplot2和tidygraph基础上的ggraph不仅可以绘制展示节点之间关联关系的网络图，也可以绘制展示更广义的关系结构或层次结构的图形。

首先，我们来看ggraph作图的一般情况，例子是来自本系列第2篇的《权利的游戏》角色网络。

将这个网络的igraph网络对象记为net_gt,使用as_tbl_graph()将这个对象转换为ggraph所需的tbl_graph对象，然后使用dplyr包的mutate()创建两个新变量：deg表示节点的度，group表示使用infomap方法计算出的节点社区：

library(tidyverse)
library(igraph)
library(ggraph)
library(tidygraph)

graph_gt <- as_tbl_graph(net_gt) %>% 
  mutate(deg = centrality_degree(mode='in'),
          group=group_infomap())

使用autograph()进行快速可视化，得到一幅ggplot2风格的网络图（图1）：

autograph(graph_gt)

图1

当然，我们需要更复杂和更美观的图形。考虑按节点度绘制节点的大小，按社区分组绘制节点颜色，对度大于12的节点标注名字，并按权重绘制边的大小（图2）：

ggraph(graph_gt, layout = 'kk') + 
geom_edge_fan(aes(edge_wi