R语言 Lung Cancer Data分析

最新推荐文章于 2023-03-29 16:02:59 发布

Mrrunsen

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分类专栏： R语言大学作业文章标签： r语言开发语言

本文链接：https://blog.csdn.net/Mrrunsen/article/details/128605249

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该博客分析了12625x56的肺癌数据矩阵，进行了主成分分析（PCA）、名义逻辑回归、LDA和SVM，以及K-means和层次聚类。PCA结果显示前三组件解释了55.8%的方差，用于散点图绘制。Logistic回归、LDA和SVM预测结果一致，准确率为1。然而，K-means和层次聚类未能合理分类样本，与实际类别不符。

摘要由CSDN通过智能技术生成

Question 2: Lung Cancer Data

The data.txt file is a 12625 x 56 matrix; each column (row) of the matrix corresponds to the individual case (gene). Among the 56 cases,

Columns 1~20: pulmonary carcinoid samples (Carcinoid);
Columns 21~33: colon cancer metastasis samples (Colon);
Columns 34~50: normal lung samples (Normal);
Columns 51~56: small cell carcinoma samples (SmallCell).

Before the following analyses, please first center each row of the data, i.e. remove the mean of each row and transpose the matrix.

library(tidyverse)
lungcancer = read.table("lungcancer.txt")
##  center each row of the data  and   transpose 
data = data.f

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R 语言中的Lung数据集生存分析

Mrrunsen的博客

05-30

1975

我们将使用 Survival 包进行分析。使用预加载在生存包中的Lung数据集，该数据集包含来自 North Central 癌症治疗组的 228 名晚期肺癌患者的数据，基于 10 个特征。数据集包含缺失值，因此假设在构建模型之前在您身边完成缺失值处理。 # Installing package install.packages("survival") # Loading package library(survival) # Dataset information ?lung # Fitti

R语言生存分析模型简介及survival包实现：基于survival包lung数据集

最新发布

DevScribe的博客

08-25

511

生存分析是一种用于研究时间至事件发生的统计方法，可以评估事件发生的概率和时间相关因素的影响。本文将介绍生存分析模型的基本概念，并演示如何使用survival包在R语言中进行生存分析建模，以lung数据集为例。生存分析是一种用于研究时间至事件发生的统计方法，可以评估事件发生的概率和时间相关因素的影响。生存曲线（survival curve）是生存函数的图形表示，反映了随时间变化的生存概率。生存曲线（survival curve）是生存函数的图形表示，反映了随时间变化的生存概率。

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Cancer-Prediction-Analysis:显示来自中北部癌症治疗组 (NCCTG) 的肺癌患者表现评分数据的预测分析的项目

05-30

预测分析项目关于数据集：原始数据集网址： : 数据集 North Central Cancer Treatment Group (NCCTG) Lung Cancer Data 描述了来自 North Central Cancer Treatment Group 的晚期肺癌患者的生存率。表现评分用于评估患者执行日常活动的能力。原始数据集的大小为 229 行 10 列。为了创建一个预测模型，我修改了这个数据集来为 Google Prediction API 创建训练数据。这个新数据集在 Google Cloud Storage 中的 URL 是“ ”。这是目前的公共链接。数据集的列如下：东部肿瘤合作组 (ECOG) 表现评分患者年龄患者性别医生评定的 Karnofsky 表现评分（差 = 0 和好 = 100）。 ECOG体能状态是用于评估患者疾病进

breast-cancer.data

03-19

乳腺癌复发数据集，由南斯拉夫卢布尔雅那大学肿瘤研究所的M. Zwitter 和 M. Soklic 于1988年捐赠。包含286条记录，10个属性（是否复发，肿瘤位置、大小、结节等），都为分类变量，可用于练习数据挖掘。

Cancer Patients Data癌症患者数据-数据集

03-08

由于癌症，许多人的生命被缩短。但是，由于大数据时代的到来，我们能够抗击这种恶意疾病。 cancer patient data sets.xlsx

breast-cancer-wisconsin.data

10-16

breast-cancer-wisconsin.data

Lung-Cancer-Detection

05-02

作为一个有趣的问题，我们（团队）决定提供各种方法来设计解决方案，因此决定解决Data Science Bowl 2017问题。数据与预处理比赛组织者提供了2类数据集。第一类是一组不同患者的CT扫描图像。数据集的第二方面...

kaggle lung cancer detection--Full Preprocessing Tuturial(附翻译)

寻找如意的博客

04-10

1989

原文链接：https://www.kaggle.com/gzuidhof/full-preprocessing-tutorial/notebookIntroductionWorking with these files can be a challenge, especially given their heterogeneous nature. Some preprocessing is req...

Integration of genomic data analysis for demonstrating potential targets in the subgroup populations of squamous cell lung cancer patients

02-22

Integration of genomic data analysis for demonstrating potential targets in the subgroup populations of squamous cell lung cancer patients

肺结节检测代码matlab-lung-cancer-detection-in-ct-scans:肺癌检测在ct扫描

06-13

prostate_data.txt

05-12

它来自 Stamey 等人的一项研究。（1989）研究了不同临床测量对前列腺特异性抗原（PSA）水平的影响。任务是根据一组临床和人口统计学变量确定前列腺癌的风险因素。

基于支持向量机（SVM）的乳腺癌诊断

03-15

支持向量机SVM是一种新的机器学习方法，其基础是统计学理论。模型泛化能力强；进行非线性分类时通过高维空间变换。

python基础语法——2 综合基础案例之乳腺癌肿瘤预测代码

海阔凭鱼跃天高任鸟飞

07-26

712

import pandas # 训练集 train = pandas.read_csv("c://train.csv") # 测试集 test = pandas.read_csv("c://test.csv") # 选取‘Clump Thickness’与‘Cell Size'作为特征，构建测试集中的正负分类样本 test_negative = test.loc[test['Type'] == ...

支持向量分类机---乳腺癌的诊断

RicheyLee的博客

08-25

3794

%原始数据cancerdata.txt可在网上下载，数据中的B替换成1，M替换成-1，X替换成2，删除了分割符*,替换后的数据命名成cancerdata2.txt clc,clear a=load('cancerdata2.txt'); a(:,1)=[]; %删除第一列病例号 gind=find(a(:,1)==1); %读出良性肿瘤的序号 bind=find(a(:,1)==-1); %读出

MATLAB-支持向量机-非线性-p213

qq_41093189的博客

01-29

810

非线性内核（首先使用线性内核发现判错率比较高） %原始数据cancerdata.txt可在网上下载，数据中的B替换成1，M替换成-1，X替换成2，删除了分割符*,替换后的数据命名成cancerdata2.txt clc,clear a=load('cancerdata2.txt'); a(:,1)=[]; %删除第一列病例号 gind=find(a(:,1)==1);

【统计模型】肺活量影响因素分析报告

m0_72318954的博客

03-29

1241

回归分析

R语言自学笔记：回归分析基础

swiiss的博客

03-08

5391

一. 线性回归 1. lm()函数返回的是对于输入变量的预测模型，返回的结果可以配合许多函数进行使用。 > lm.model <- lm(wt ~ mpg, data = mtcars) > coefficients(lm.model) # 提取系数 (Intercept) mpg 6.047255 -0.140862 > confint(lm.model, level=0.95) # 得到线性模型相关系数的分布后，限定区间，得到边界点的值.

R语言生存分析

weixin_48682719的博客

03-08

4002

R语言数据分析之生存分析

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