Nextstrain的安装教程

已于 2023-12-16 10:51:59 修改
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文章标签： python 学习方法
于 2023-12-14 07:58:59 首次发布
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本文提供Nextstrain的安装教程，首先介绍如何在Linux系统中安装虚拟机和Ubuntu，然后详细讲解如何通过Conda安装Nextstrain CLI，包括下载Conda、安装nextstrain-cli以及验证安装成功的过程。
摘要由CSDN通过智能技术生成

Nextstrain是一款利用病原体基因组数据，分析其分子进化和传播路线的平台，由 Trevor Bedford教授 的团队研发；它基于 Python、Java和Shell 等多种语言编写，可以在 macOS、Windows和Linux系统 中运行；如今，Nextstrain已被广泛应用于新冠、流感和登革热等多种病原体的进化分析，为传染病的分子流行病学研究 和公共卫生监测事业 提供帮助。

         Trevor Bedford（Trevor Bedford）是美国Fred Hutchinson癌症研究中心下 疫苗和传染病部门的教授，致力于研究病毒基因组序列，以此了解病毒进化 和驱动病毒爆发和流行的因素。

本文主要介绍Nextstrain的安装流程，可以在官网或Github上了解到更多的原理和功能。

官网链接：Welcome to Nextstrain’s documentation! — Nextstrain documentation

Github链接：Nextstrain · GitHub

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