FoldX是一款能分析突变对蛋白质结构稳定性、折叠自由能和动力学影响的工具,它基于C++语言编写,可以在Windows、Linux 和 Mac OS三种系统中安装运行。它被广泛应用于酶和病毒(例如新冠病毒Spike蛋白,肠道病毒衣壳蛋白等)等生物大分子的分析研究。
本文介绍FoldX的安装流程。FoldX有两种运行方式:
①通过终端直接运行(Windows系统终端下运行,下图):
②通过YASARA交互式界面运行(需另安装yasara程序:YASARA是一款能实现分子可视化、建模和仿真的综合性工具,基于Python编写,功能类似于Pymol,下图):
下面开始介绍FoldX安装过程(以Windows系统为例):