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RSS订阅原创 单细胞数据质控-Doublefinder（去除双细胞）【day7】
barcodes计数深度低，检测到的基因很少且线粒体计数高，这表明细胞的细胞质mRNA已通过破膜渗出，因此，仅位于线粒体中的mRNA仍然在细胞内。相反，具有非预期高计数和检测到大量基因的细胞可能代表双细胞。
2023-11-17 21:43:55
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原创 Anaconda与pycharm的安装与环境配置（day4）
官网免费下载地址：但是官网下载龟速，建议到下载社区版本（日常学习使用够用了），专业版是收费的哦（功能更强大）
2023-11-09 21:18:38
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原创 cellranger使用的初步探索:cellranger aggr(实验日记day4)
【代码】cellranger使用的初步探索:cellranger aggr(实验日记day4)
2023-11-09 14:46:12
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原创 利用cellranger对（人）单细胞数据进行上游分析(实验室日记day1和day2)
如果测到的细胞数多，但是每个细胞里面的平均reads数少，那么饱和度就不高，反之，饱和度高。但也不是越高越好，背后原理是抽样的原理，到达80%左右就可以代表整个样本。下载命令的某些部分会定期更改，因此复制官网上面的确切命令可能不起作用。Estimated number of cells - 样本测到的细胞数。Mean reads per cell - 每个细胞测到的平均reads。三、对人的参考基因组和注释进行下载和解压（ensembl官网）一、Cellranger以及参考基因组的下载。
2023-11-08 15:01:11
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原创 动手深度学习(李沐）7-18
只要以管理员身份运行打开anaconda promote窗口重新启动jupyter notebook即可（或者以管理员身份运行打开jupyter notebook（pytorch）窗口）PermissionError: [WinError 5] 拒绝访问。
2023-07-18 16:30:50
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空空如也
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