DLP算法

最新推荐文章于 2024-12-10 20:21:41 发布

Ritannn

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分类专栏： bioinformatics 文章标签：算法机器学习 dlp

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本文链接：https://blog.csdn.net/Ritannn/article/details/120594014

版权

本文介绍了DLP算法，它基于转移学习预测基因-表型关联。利用限制内存的BFGS优化方法（LBFGSB），针对已知关联进行计算，其他则视为0。算法输入包括训练的基因-表型关联、标准化PPI权重网络矩阵和表型本体二进制图矩阵，输出是经过标签传播得到的新关联预测。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

读《Transfer learning across ontologies forphenome–genome association prediction》

其中LBFGSB是限制内存的箱形约束优化的BFGS函数，属于最优化的内容。

第七行可以写出如下：

$\frac{\partial \psi _{DLP}(Y)}{\partial Y}=(Y-\widehat{Y})_W+\beta YL_s+\gamma L_{G_Y}Y$

其中 $(Y-\widehat{Y})_W$ 只对已知关联做计算，其它的计为0。

输入

该算法的输入为 $\widehat{Y}$ ，

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