tlDLP算法

读《Transfer learning across ontologies forphenome–genome association prediction》

其中LBFGSB是限制内存的箱形约束优化的BFGS函数，属于最优化的内容。

 第十一行可以写成如下：

第十六行可以写成如下：

其中和只对已知关联做计算，其它的计为0。

 输入

该算法的输入为：：

1. 第一个是已知的用于训练的基因-功能关联；
2. 第二个是已知的用于训练的基因-表型关联；
3. 第三个是标准化后的PPI权重网络的矩阵；
4. 第四个是是标准化后基因本体的二进制图的矩阵；
5. 第五个是是标准化后表型本体的二进制图的矩阵；

输出

该算法的输出为X，Y，即经过标签传播达到最大次数迭代或者收敛后新的基因-功能关联和基因-表型关联。