1、肽库构建与筛选
肽库概念:
肽库,是大量特定长度且序列不同的小肽的集合,它包括了该长度短肽中各种(或绝大部分)氨基酸序列的排列组合。有些多肽虽然其序列与抗原的天然表位不同,但在结合抗体或配体时的方式是相同的,因此这种具有关键氨基酸残基的多肽称为模拟表位(mimotope)。模拟表位的概念在肽库发展过程中起到了重要的推动作用。肽库能够为药物设计,蛋白质-蛋白质相互作用以及其他生化和药物研究和应用提供强大的工具。
生物学和化学研究中,多肽文库是一种强大的筛选工具。它用于从大批量多肽中筛选极少量具关键生物活性的多肽。多肽文库在蛋白质组学及其相关领域应用范围非常广泛,如药物研发、蛋白-蛋白相互作用、抗原表位筛选、GPCR配体筛选、蛋白功能分析、酶底物或抑制剂筛选、信使分子研发及多肽/蛋白信号对答等。
2、多肽文库类型
首尾相搭多肽矩阵(Overlapping Peptide Library): 主要用于全蛋白扫描。蛋白从N端开始,逐步向C端截取设计后,最后很有可能会剩下一条孤肽(Orphan peptide),我们建议一般是将N端转移一个或者几个氨基酸过来,以保持一致长度。
截头多肽矩阵(Truncation Peptide Library): 用于确定表位的最小范围。截头多肽矩阵的建立方法一般是系统性