多肽数据库

最近开启了新的课题是关于多肽的,俗话说磨刀不误,收集质量好的数据是建立模型的第一步。

许多以前的研究已经指出,严格的数据集对于精确估计预测模型的质量至关重要。

特别是,序列一致性(sequence identity)别对数据集的质量有很大的影响。如果序列具有较高的序列一致性,则很容易产生偏差估计。换句话说,较低的序列一致性意味着更高的数据集质量。

下面列出常见的多肽数据库

这篇知乎文章有详细的介绍 多肽数据库的小总结 - 知乎 (zhihu.com)

信号肽数据库: Signal Peptide Database

抗菌活性和肽结构数据库: Antimicrobial Peptide Database - DBAASP

抗菌肽数据库: Antimicrobial Peptide Database (unmc.edu)

细胞穿透肽数据库: CPPsite 2.0: A Database of Cell Penetrating Peptides (osdd.net)

肽抗原数据库:Antigenic Peptides-GenScript

治疗肽数据库: THPdb: A Database of FDA approved Therapeutic Peptides and Proteins (osdd.net)

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