Slicer5.7.0导入DICOM反向或失败的源码修改

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问题描述

使用 Slicer 5.7.0 加载部分 DICOM 数据时会加载失败，加载失败的形式为：

但是同样的数据在 5.6.2 版本中不会出现。

并且在 DICOM 数据库中，右键显示元数据，数据本身也是正常的：

解决过程

变换矩阵

在 data 列表中，发现有一个多余的变换 transform 存在，删除该变换后，DICOM 数据正常打开，但是是反向的。

创建新的变换，可以编辑变换矩阵，将反向方向修改为 -1：

再在切片视图中去重置视场，可以看到数据正向了：

但是修复后的数据，如果进行 AI 计算肺血管等操作，却出现了错位的情况：

修改源码

上一个方法只能解决表面问题，并不能真正解决 DICOM 导入的问题，所以还需要研究源码来探究出现问题的地方。

思路是根据 5.6.2 与 5.7.0 的源码差距进行比对，寻找涉及 Dicom、oriented、grid、transform 的修改，因为错误是 DICOM 导入后，有一个变换矩阵的方向错误。

追踪到发现可能不是 Slicer 源码修改带来的问题，问题应该是存在于 VTK 和 ITK 中的。

查看版本更新发现 ITK 的版本发生了变化，从 5.3.0 到 5.4.0。

涉及到了 ITK 的版本变化带来的问题，寻求社区的帮助，定位问题到 seriesReader 的方向矩阵处理。

所以修改这里就行，代码是：Slicer/Libs/vtkITK/vtkITKArchetypeImageSeriesReader.cxx

  itk::OrientImageFilter<ImageType,ImageType>::Pointer orient =
    itk::OrientImageFilter<ImageType,ImageType>::New();
  itk::ImageSeriesReader<ImageType>::Pointer seriesReader =
    itk::ImageSeriesReader<ImageType>::New();
  seriesReader->SetFileNames(this->FileNames);
  seriesReader->SetImageIO(imageIO);
  seriesReader->SetForceOrthogonalDirection(false); // 添加此句
  if (this->UseNativeCoordinateOrientation)
  {
    filter = seriesReader;
  }

省流

添加语句：

seriesReader->SetForceOrthogonalDirection(false);

到文件：
Slicer/Libs/vtkITK/vtkITKArchetypeImageSeriesReader.cxx
的第 684 行 seriesReader->SetImageIO(imageIO); 后面就行。