Rcpp实用手册

1.数据类型介绍

C++对应于R的数据类型有如下这些：
double⇔numeric
int⇔integer
String⇔character
logical⇔bool

在C++中可以直接使用R的对象有:`

• 向量:NumericVector、IntegerVector、CharacterVector
• 矩阵:NumericMatrix、IntegerMatrix、CharacterMatrix
• 数据框:DataFrame
• 列表:List
• 函数:Function
• 其他类型:Environment,ComplexVector,RawVector,DottedPair,Language,Promise,Symbol,WeakReference

2.语法糖

算术和逻辑运算符

所有算术逻辑运算符都是可以向量化的：+,-,*,/,pow,<,<=,>,>=,==,!=,!

#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp;

// [[Rcpp::export]]
NumericVector pdistC2(double x, NumericVector ys) {
  return sqrt(pow((x - ys), 2));
}

其他有用的函数

• 数学函数: abs(), acos(), asin(), atan(), beta(), ceil(), ceiling(), choose(), cos(), cosh(), digamma(), exp(), expm1(), factorial(), floor(), gamma(), lbeta(), lchoose(), lfactorial(), lgamma(), log(), log10(), log1p(), pentagamma(), psigamma(), round(), signif(), sin(), sinh(), sqrt(), tan(), tanh(), tetragamma(), trigamma(), trunc().

• 汇总函数: mean(), min(), max(), sum(), sd(), and (for vectors) var()

• 返回向量的汇总函数: cumsum(), diff(), pmin(), and pmax()

• 查找函数: match(), self_match(), which_max(), which_min()

• 重复值处理函数: duplicated(), unique()

所有标准分布的 d/q/p/r 函数
以及 noNA(x) 判断向量x不包含任何缺失值，并允许一些数学运算上的优化。

STL

这是C++所拥有的模板库，用过C++的应该都知道，具体可以到这里看boost(http://www.boost.org/doc)

迭代器

我们可以使用迭代器来操纵R的对象。

#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp;

// [[Rcpp::export]]
double sum3(NumericVector x) {  //该函数实现了对x的求和
  double total = 0; 

  NumericVector::iterator it;
  for(it = x.begin(); it != x.end(); ++it) {
    total += *it;
  }
  return total;
}

要注意每个数据结构类型都有一个迭代器，
比如NumericVector::iterator和 CharacterVector::iterator是不同的。

数据结构

STL所提供的数据结构也是可以使用的，Rcpp知道如何将STL的数据结构转换成R的数据结构，所以可以从函数中直接返回他们，而不需要自己进行转换。
这些数据结构有：array, bitset, list, forward_list, map, multimap, multiset, priority_queue, queue, dequeue, set, stack, unordered_map, unordered_set, unordered_multimap, unordered_multiset, vector.

具体的使用方法可以参考：http://www.cplusplus.com/reference/stl/

本文参考文献：http://adv-r.had.co.nz/Rcpp.html

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