聚集图clustermap,将矩阵数据集绘制成分层聚类热图,它的函数里面其实是使用了heatmap的,但是加上了聚类功能,使得其绘制出来的热力图具有横向样本(sample)和纵向基因(gene)的聚类功能。它的语法为:
clustermap(data, *, pivot_kws=None, method='average',
metric='euclidean',z_score=None, standard_scale=None,
figsize=(10, 10),cbar_kws=None, row_cluster=True,
col_cluster=True, row_linkage=None, col_linkage=None,
row_colors=None, col_colors=None, mask=None,
dendrogram_ratio=.2,colors_ratio=0.03,
cbar_pos=(.02, .8, .05, .18), tree_kws=None, **kwargs)
pivot_kws:dict,如果数据是整齐的数据框架,可以为 pivot 提供关键字参数以创建矩形数据框架;