EasySeq
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风中飞鸟
这个作者很懒,什么都没留下…
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Easyseq v1.0 核酸序列处理工具
简单介绍Easyseq工具的概念和组成原创 2024-08-04 12:00:25 · 576 阅读 · 0 评论 -
附件:Easyseq源码([1]match)
use Cwd;$pairs=1;close DATA;$c=0;$e=1;$OF=1;$OR=1;$OP=1;$NF2=1;$NR2=1;$NP2=1;{$OF=0;{$OR=0;{$OP=0;{$NF2=0;{$NR2=0;{$NP2=0;原创 2024-08-04 12:02:11 · 245 阅读 · 0 评论 -
附件:Easyseq源码([2]classify)
#!/usr/bin/perluse Bio::SeqIO;use Bio::Seq;use Tie::File; use Cwd;my $location_dir=getcwd; $location_dir=~s/\//\\/;my @file = glob("$location_dir\\*.filter"); foreach my $file(@file){ open(DATA,"<$file") or die "Can't open $file";原创 2024-08-04 12:02:44 · 277 阅读 · 0 评论 -
附件:Easyseq源码([3]maplus)
use Cwd;$pairs=1;close DATA;$r=\@r;$pai=1;$mm=0;$n=0;LOOP:do{if($n==0){if($n==1){if($n==2){$c=0;原创 2024-08-04 12:04:23 · 557 阅读 · 0 评论 -
附件:Easyseq源码([4]mutation)
use Cwd;$pairs=1;close DATA;$pai=1;Primer;ID\n";close WH;$num=0;LOOP:do{$c1=0;原创 2024-08-04 12:05:43 · 752 阅读 · 0 评论 -
附件:Easyseq源码([5]extractid)
use Cwd;close DATA;close WH;原创 2024-08-04 12:06:30 · 317 阅读 · 0 评论 -
附件:Easyseq源码([6]cut)
use Cwd;close DATA;$seqs=$seq;close WH;原创 2024-08-04 12:07:01 · 367 阅读 · 0 评论 -
附件:Easyseq源码([7]mismatch)
use Cwd;close DATA;}else{}else{}else{close WH;$NF2=$NF;}else{$NP2=$NP;}else{$NR2=$NR;}else{原创 2024-08-04 12:08:54 · 485 阅读 · 0 评论 -
附件:Easyseq源码([0]filter)
use Cwd;close DATA;$seqs=$seq;close WH;原创 2024-08-04 12:01:39 · 382 阅读 · 0 评论