VASP学习记录与总结

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师从大师兄,有兴趣可以私信交流,学习教材来源:learn VASP The Hard Way

VASP是什么?即Vienna Ab-initio Simulation Package,是维也纳大学Hafner小组开发的进行电子结构计算和量子力学-分子动力学模拟软件包。它是目前材料模拟和计算物质科学研究中最流行的商用软件之一。

说明:
Ab-initio——量子化学从头算起法
本人是windows用户,后文都以windows系统标准说明。

1 学习记录

1.1 十一月23日的学习

学习必备参考书:Density Functional Theory: A Practical Introduction (David Sholl)

学习必备网站:VASP官网VASP官方论坛


注意:windows用户计算出错时,首要解决方案:dos2unix

需要安装基础软件:
文字编辑软件:notepad++
建模相关软件:Material Studio、p4vaspVESTA


四个基本输入文件:INCAR,KPOINTS,POSCAR,POTCAR
总结:VASP基本输入文件的准备(小结)


批量处理部分初学可以先不看,选择跳过继续阅读下去~

关于VASP任务的提交:
一般来说超算中心使用的都是linux系统,基本操作指令大同小异,基本没有区别。
这里以本人所在课题组所用的超算中心为例,仅供参考:我们采用的是HPCPlus平台
1、 把脚本vasp-5.4.4.lsf 和其他四个输入文件放在同一个文件夹里;
2、 登录超算中心,点击网页版命令下面的文件传输,建立自己的文件夹,把五个文件上传至超算的文件夹里;
3、 点击终端命令,打开登录结点命令,进入刚建立的文件夹,输入bsub -J Jobname<vasp-5.4.4.lsf(其中Jobname可以换成自己的项目名字),回车运行。这里我换成 bsub -J Zachary_Job<vasp-5.4.4.lsf
注:
进入-cd;
查看当前目录-ls

运算过程中可以多用一下命令查看进度:

  • cat oszicar查看运行步数,其中关注E0
  • bjobs

运行完成后文件夹中会出现一系列输出文件,目前需要掌握的是这三个输出文件:
1、CONTCAR是结构优化后,存储新结构的文件,即优化版的POSCAR;
2、OSZICAR是记录优化过程一些信息的文件,通过OSZICAR获取体系的能量,也就是E0后面的那一项;
3、 OUTCAR是关于我们当前计算的一个非常全面的,多方位的信息汇总。
强调:不知道的参数,不要瞎往INCAR里面放!新手的话经常会加一些乱七八糟的参数,导致计算错误

1.2 十一月24日的学习

1.3 O 2 _2 2分子体系计算

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