0 说明
- 以
RScript
的形式运行R
文件。 - 确定需要的包安装在环境变量对应的
R应用软件
上,否则会显示找不到。 - 推荐直接打开
R.exe
安装,而不是通过Rstudio
安装。
1 安装R3.5.1
2 命令行运行R
- 打开
CMD
或者Terminal
- 输入
R
- if (能够打开)
- 说明环境变量设置正确
- else
- 修改环境变量
- if 系统 =
mac
- 打开
Terminal
输入
export PATH="/Users/YOURNAME/R-3.5.1/bin:$PATH"
- if (系统 = windows)
- 搜索 环境变量 打开设置页面
- if (可以逐行修改)
- 添加一行 输入 G:\R-3.5.1\bin
- else
- 在原有的基础上添加;G:\R-3.5.1\bin
- if (可以逐行修改)
- 搜索 环境变量 打开设置页面
- if 系统 =
- 修改环境变量
3 安装BiocManager
- 打开
CMD
或者Terminal
- 输入
R
,进入R语言环境install.packages("BiocManager")
- 弹出页面,选择中国的镜像
- if (安装错误)
- 去 官网 下载,对应OS的安装包。找到
Windows binaries
或者OS X binaries
,下载r-release
。 - 解压缩,里面是一个
BiocManager
文件夹。 - 放到 安装路径/library 文件夹中
- 去 官网 下载,对应OS的安装包。找到
4 安装DECIPHER
BiocManager::install("DECIPHER")
- if (提示 Rcpp 或者 RSQLite 安装失败)
- 重复安装直到成功
install.packages("RSQLite")
install.packages("Rcpp")
5 验证安装成功
CMD
或者Terminal
中打开R
。library(DECIPHER)