微生物+计算细胞倍增时间

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1 简介

虽然做生长曲线和求代际时间貌似是个很简单常规的东西，可是到我一直不大确定自己求的对不对...
这次下定决心不再乱做...
不看解释，跳到作图

2 定义

微生物

• 细菌，真菌

培养和测定

• 细菌：液体培养，不同的时间测定OD₆₀₀的吸光度。固体培养稀释涂布测定colony forming unit（CFU）数量。

• 真菌：平皿固体培养，不同时间测定半径。

  对 细菌 来说每个细胞都有分裂能力，但是真菌只有尖端的细胞在进行分裂，后面的细胞在增长（Chang）。

描述生长的一些度量

• 瞬时生长速度（growth rate）：
  • 细菌：在单位时间里测量值得变化。
  • 真菌：径向生长速度：radial growth rate K_r，有的时候叫colony radial growth rate。
  • 单位：测量单位/单位单位，比如CFU/h，μm/h。
  • 生长速度与生长条件，初始浓度等有关系。
• 单位生长率（specific growth rate），μ 表示。
  • 描述的是在指数生长期的生长能力。
  • 单位是 时间-1，可以是任何时间单位，通常用 h-1。
• 相对生长速度（relative growth rate） 相对当前生物量的生长速度，如果大小为一个常数，则用 k 表示。
  • 因为在德语里面常量是 konstant 所以缩写成 k，有的时候又用的 C 表示常量，嗯，是 constant。
  • 单位也是 时间-1。
  • 注意 k 和 μ 不一样。
• 细胞倍增时间（doubling time）：t_d，也称为代际时间，代时（generation time）：g。
  • \(g=1/μ\)

  • \(g=ln2/k\)

    从这里也能看出 μ 和 k有个倍数差距。后面公式推导再说明。

说明

• 细菌测定是OD不是细胞数量，如果要知道绝对数量需要测定OD和CFU之间的关系。
• 不管原始数据是什么，其形式都是X：t1到t2的时间点 ，Y:生长状态的度量。
• Y轴取对数，指数生长期为一条直线。这是判断指数生长的标准。
• 【重点】生长速度 描述的是一种状态，而 k 和 μ 是一种能力，他们之间没有特定的转换关系，但是你能计算出当微生物以 k