Genscan指南

Genscan指南

GenScan是一个gene识别软件，主要是通过已知生物的基因结构特征来识别新的基因（parse）。所利用的基因特征请参看readme文件。

特点：

1. 只考虑编码蛋白的基因。
2. 模型考虑每个sequence可能有0个，1个，多个，甚至双链都有基因。
3. 假设transcription units没有overlapping。

Input:

基因组序列

Output:

1. 文本文件：识别出来的外显子基因，翻译后的蛋白质序列。
2. 图形文件：展示预测外显子的位置

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1. 安装

安装要求：

N kilobases的序列需要 N/2 Megabytes of RAM

获取软件

Genscan对学术用户免费，需要在这里提交你的姓名和地址后下载Intel/Linux distribution。此时还可以看到readme文件

下载到的文件是genscanlinux.tar.uue

安装步骤