功能富集分析
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开发的GRSA和其他常用富集分析方法
Asa12138
浙大博士生，生物信息学专业，分享科研代码，经验。推文一般很长，努力将一个问题讲全面，感谢你的耐心阅读。
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ReporterScore包(GRSA方法)正式发表于杂志Briefings in Bioinformatics
最近，我开发的R包ReporterScore（GRSA方法）发表在杂志Briefings in Bioinformatics上，这是一种灵活的，可用于复杂多组学数据的功能富集新方法。原创 2024-03-31 00:34:03 · 925 阅读 · 0 评论
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ReporterScore 包的一些更新
最近ReporterScore 包又新加了一些好用的功能原创 2023-11-09 00:06:38 · 216 阅读 · 1 评论 -
使用ReporterScore包进行富集分析
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Reporter Score 微生物功能富集分析
Reporter score是一种改良的微生物富集分析的新方法，这里分享其原理和一个实现的R包。原创 2023-05-15 15:03:19 · 2135 阅读 · 15 评论 -
基因集富集分析(GSEA)简介
Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) 是一种用于分析基因表达数据的计算生物学方法，旨在揭示与特定生物学过程、通路或功能相关的基因表达模式。原创 2023-09-21 18:56:57 · 10154 阅读 · 1 评论 -
KEGG 数据库及API (2)
KEGG是一个广泛使用的生物信息学数据库，用于研究基因组、代谢组、信号通路和生物化学反应等方面的信息，这里就要介绍非常重要的操作：通过api查询和下载KEGG数据库内容。原创 2023-08-17 14:41:26 · 1213 阅读 · 1 评论 -
KEGG 数据库及API (1)
KEGG是一个广泛使用的生物信息学数据库，用于研究基因组、代谢组、信号通路和生物化学反应等方面的信息，这里介绍一下数据库的主要模块。原创 2023-08-17 14:39:09 · 4299 阅读 · 1 评论