KEGG 数据库及API (2)

最新推荐文章于 2024-08-31 23:40:08 发布
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分类专栏： 功能富集分析 生信数据库 文章标签： 数据库
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/Asa12138/article/details/132340654
版权

Introduction

KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）是一个广泛使用的生物信息学数据库，用于研究基因组、代谢组、信号通路和生物化学反应等方面的信息。它提供了基因、蛋白质、代谢物和信号通路等生物分子的综合信息，帮助研究人员理解生物体内分子之间的相互作用和功能。

上一篇文章已经介绍了各种KEGG重要的子数据库，在这里就要介绍非常重要的操作：通过api查询和下载KEGG数据库内容。

API for download

KEGG API是和KEGG内核数据库进行交互的程序界面，允许用户基于该界面检索KEGG数据库，该界面的运行基于用户电脑的浏览器，在浏览器地址栏书写相应的地址指令即可检索KEGG数据库条目，该地址指令的编写规则如下所示：

http://rest.kegg.jp/<operation>/<argument >[/<argument2>...]

其中operation可选info、list、find、get、conv、link、ddi，后面的参数可以是数据库名称以及选项。

包含的database有:

<database> = KEGG databases (Table 1) and Outside databases integrated in KEGG (Table 2)

           = pathway | brite | module | ko | <org> | vg | vp | ag | genome | compound |
             glycan | reaction | rclass | enzyme | network | variant | disease |
             drug | dgroup | disease_ja | drug_ja | dgroup_ja | compound_ja |
             genes | ligand | kegg | <outside_db>

<org> = KEGG organism code

<outside_db> = pubmed | ncbi-geneid | ncbi-proteinid | uniprot | pubchem | chebi |
               atc | jtc | ndc | yj

所有操作的输出都是文本格式: - list, find, conv and link返回的制表符分隔文本 - get 返回平面文件数据库格式 - info 返回普通txt

info

info操作显示数据库发布信息以及数据库的统计信息。除了kegg、genes和ligand之外，该操作还显示可以在link操作中使用的链接数据库列表。

示例 : 查看pathway 数据库的基本信息，命令http://rest.kegg.jp/info/pathway

url="http://rest.kegg.jp/info/pathway"
httr::GET(url)

## Response [https://rest.kegg.jp/info/pathway]
##   Date: 2023-08-17 06:07
##   Status: 200
##   Content-Type: text/plain; charset=utf-8
##   Size: 471 B
## pathway          KEGG Pathway Database
## path             Release 107.0+/08-17, Aug 23
##                  Kanehisa Laboratories
##                  1,073,907 entries
## 
## linked db        module
##                  ko
##                  <org>
##                  genome
##                  compound
## ...

list

list操作可用于获取每个数据库中所有条目的列表。 可用genes, ligand and kegg以外的数据库。

1.https://rest.kegg.jp/list/<database>

<database> = pathway | brite | module | ko | <org> | vg | vp | ag | genome | compound |
             glycan | reaction | rclass | enzyme | network | variant | disease |
             drug | dgroup | organism
             
2.https://rest.kegg.jp/list/pathway/<org>

3.https://rest.kegg.jp/list/brite/<option>

<option> = br | jp | ko | <org>

4.https://rest.kegg.jp/list/<dbentries>

<dbentries> = Entries of the following <database>
<database> = pathway | brite | module | ko | <org> | vg | vp | ag | genome | compound |
             glycan | reaction | rclass | enzyme | network | variant | disease |
             drug | dgroup

第一种，查看数据库中所有的记录:http://rest.kegg.jp/list/ko

K00001	E1.1.1.1, adh; alcohol dehydrogenase [EC:1.1.1.1]
K00002	AKR1A1, adh; alcohol dehydrogenase (NADP+) [EC:1.1.1.2]
K00003	hom; homoserine dehydrogenase [EC:1.1.1.3]
K00004	BDH, butB; (R,R)-butanediol dehydrogenase / meso-butanediol dehydrogenase / diacetyl reductase [EC:1.1.1.4 1.1.1.- 1.1.1.303]
K00005	gldA; glycerol dehydrogenase [EC:1.1.1.6]
K00006	GPD1; glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD+) [EC:1.1.1.8]
...

当生物体代码已知时，可以使用第二种形式来获取生物体特异性途径的列表，仅在list操作中允许使用特殊数据库名称"organism"，可用于获取具有三或四字母生物体代码的 KEGG 生物体列表: https://rest.kegg.jp/list/pathway/hsa

hsa01100	Metabolic pathways - Homo sapiens (human)
hsa01200	Carbon metabolism - Homo sapiens (human)
hsa01210	2-Oxocarboxylic acid metabolism - Homo sapiens (human)
hsa01212	Fatty acid metabolism - Homo sapiens (human)
hsa01230	Biosynthesis of amino acids - Homo sapiens (human)
...

第三种形式是 brite 层次结构的类似选项: https://rest.kegg.jp/list/brite/br

br08901	KEGG pathway maps
br08902	BRITE hierarchy files
br08904	BRITE table files
br08906	BRITE binary relation files
br08907	KEGG networks
...

第四种形式可以用于获取给定的一组数据库条目标识符的定义列表: http://rest.kegg.jp/list/map00010+map00040。可以给出的标识符的最大数量为{.uri} 10。

map00010	Glycolysis / Gluconeogenesis
map00040	Pentose and glucuronate interconversions

find

find是一个搜索操作,查找具有匹配查询关键字或其他查询数据的条目。

1.https://rest.kegg.jp/find/<database>/<query>

<database> = pathway | brite | module | ko | genes | <org> | vg | vp | ag | genome |
             ligand | compound | glycan | reaction | rclass | enzyme | network |
             variant | disease | drug | dgroup
             
2.https://rest.kegg.jp/find/<database>/<query>/<option>

<database> = compound | drug
<option> = formula | exact_mass | mol_weight | nop

第一种形式搜索如下所示的条目标识符和关联字段以查找匹配的关键字：http://rest.kegg.jp/find/genes/shiga+toxin 。

ece:Z1464	stx2A; shiga-like toxin II A subunit encoded by bacteriophage BP-933W
ece:Z1465	stx2B; shiga-like toxin II B subunit encoded by bacteriophage BP-933W
ece:Z3343	stx1B; shiga-like toxin 1 subunit B encoded within prophage CP-933V
ece:Z3344	stx1A; shiga-like toxin 1 subunit A encoded within prophage CP-933V
...

在第二种形式中，化学式搜索是部分匹配，与给定的原子顺序无关：http://rest.kegg.jp/find/compound/C7H10O5/formula 。通过四舍五入到与查询数据相同的小数位来检查精确的质量（或分子量）。 也可以使用减号 (-) 指定值的范围。

cpd:C00493	C7H10O5
cpd:C04236	C7H10O5
cpd:C16588	C7H10O5
cpd:C17696	C7H10O5
cpd:C18307	C7H10O5
cpd:C18312	C7H10O5
...

get

此操作以平面文件格式或带有选项的其他格式检索给定的数据库条目。平面文件格式适用于除 brite 之外的所有 KEGG 数据库。

输入最多 10 个条目。选项允许检索选定字段，包括基因条目中的序列数据、化合物、聚糖和药物条目中的化学结构数据或 gif 图像文件、途径条目中的 png 图像文件或 kgml 文件。输入仅限于带有图像选项的一种化合物/聚糖/药物条目，以及带有图像或 kgml 选项的一种通路条目。

例子1: http://rest.kegg.jp/get/C01290+G00092 检索人类基因条目和大肠杆菌 O157 基因条目

ENTRY       C01290                      Compound
NAME        Lactosylceramide;
            beta-D-Galactosyl-(1->4)-beta-D-glucosyl-(1<->1)-ceramide;
            beta-D-Galactosyl-1,4-beta-D-glucosylceramide;
            Gal-beta1->4Glc-beta1->1'Cer;
            LacCer;
            Lactosyl-N-acylsphingosine;
            D-Galactosyl-1,4-beta-D-glucosylceramide
...

例子2: http://rest.kegg.jp/get/hsa:10458/aaseq 检索人类基因的氨基酸序列, 支持 aaseq 和 ntseq

>hsa:10458 K05627 BAI1-associated protein 2 | (RefSeq) BAIAP2, BAP2, FLAF3, IRSP53, WAML; BAR/IMD domain containing adaptor protein 2 (A)
MSLSRSEEMHRLTENVYKTIMEQFNPSLRNFIAMGKNYEKALAGVTYAAKGYFDALVKMG
ELASESQGSKELGDVLFQMAEVHRQIQNQLEEMLKSFHNELLTQLEQKVELDSRYLSAAL
KKYQTEQRSKGDALDKCQAELKKLRKKSQGSKNPQKYSDKELQYIDAISNKQGELENYVS
DGYKTALTEERRRFCFLVEKQCAVAKNSAAYHSKGKELLAQKLPLWQQACADPSKIPERA
VQLMQQVASNGATLPSALSASKSNLVISDPIPGAKPLPVPPELAPFVGRMSAQESTPIMN
GVTGPDGEDYSPWADRKAAQPKSLSPPQSQSKLSDSYSNTLPVRKSVTPKNSYATTENKT
LPRSSSMAAGLERNGRMRVKAIFSHAAGDNSTLLSFKEGDLITLLVPEARDGWHYGESEK
TKMRGWFPFSYTRVLDSDGSDRLHMSLQQGKSSSTGNLLDKDDLAIPPPDYGAASRAFPA
QTASGFKQRPYSVAVPAFSQGLDDYGARSMSRNPFAHVQLKPTVTNDRCDLSAQGPEGRE
HGDGSARTLAGR

例子3: http://rest.kegg.jp/get/hsa00600/image 检索通路图的 png 图像文件, 支持 image ,image2x， conf， kgml，但是一次只允许查询1条记录

conv

conv操作可用于将外部数据库的条目标识符（登录号）转换为 KEGG 标识符，反之亦然。

1.https://rest.kegg.jp/conv/<target_db>/<source_db>

(<target_db> <source_db>) = (<kegg_db> <outside_db>) | (<outside_db> <kegg_db>)

For gene identifiers:
<kegg_db> = <org>
<org> = KEGG organism code or T number
<outside_db> = ncbi-geneid | ncbi-proteinid | uniprot

For chemical substance identifiers:
<kegg_db> = compound | glycan | drug
<outside_db> = pubchem | chebi

2.https://rest.kegg.jp/conv/<target_db>/<dbentries>

For gene identifiers:
<dbentries> = database entries of the following <database>
<database> = <org> | genes | ncbi-geneid | ncbi-proteinid | uniprot
<org> = KEGG organism code or T number

For chemical substance identifiers:
<dbentries> = database entries of the following <database>
<database> = compound | glycan | drug | pubchem | chebi

第一种形式允许数据库到数据库的映射：https://rest.kegg.jp/conv/eco/ncbi-geneid 。

ncbi-geneid:944742	eco:b0001
ncbi-geneid:945803	eco:b0002
ncbi-geneid:947498	eco:b0003
ncbi-geneid:945198	eco:b0004
ncbi-geneid:944747	eco:b0005
ncbi-geneid:944749	eco:b0006
...

而第二种形式允许转换选定数量的条目：https://rest.kegg.jp/conv/ncbi-proteinid/hsa:10458+ece:Z5100 。"genes"数据库只能以第二种形式使用。

hsa:10458	ncbi-proteinid:NP_059345
ece:Z5100	ncbi-proteinid:AAG58814

link

link操作允许检索所有 KEGG 数据库内以及 KEGG 数据库与外部数据库之间的交叉引用。 它对于寻找各种关系非常有用，例如基因和通路之间的关系。

1.https://rest.kegg.jp/link/<target_db>/<source_db>

<target_db> = <database>
<source_db> = <database>

<database> = pathway | brite | module | ko | <org> | vg | vp | ag | genome | compound |
             glycan | reaction | rclass | enzyme | network | variant | disease |
             drug | dgroup | <outside_db>
<outside_db> = pubmed | atc | jtc

2.https://rest.kegg.jp/link/<target_db>/<dbentries>

<dbentries> = KEGG database entries of the following <database>
<database> = pathway | brite | module | ko | <org> | vg | vp | ag | genome | compound |
             glycan | reaction | rclass | enzyme | network | variant | disease |
             drug | dgroup | <outside_db>
<outside_db> = pubmed | atc | jtc

第一种形式允许检索数据库到数据库的交叉引用：https://rest.kegg.jp/link/pathway/hsa 或https://rest.kegg.jp/link/hsa/pathway 。

hsa:10327	path:hsa00010
hsa:124	path:hsa00010
hsa:125	path:hsa00010
hsa:126	path:hsa00010
hsa:127	path:hsa00010
hsa:128	path:hsa00010
hsa:130	path:hsa00010
...

而第二种形式允许检索选定数量的条目：https://rest.kegg.jp/link/pathway/hsa:10458+ece:Z5100 。 "genes"数据库只能用于第二种形式中的"ko"条目。

hsa:10458	path:hsa04520
hsa:10458	path:hsa04810
hsa:10458	path:hsa05130
hsa:10458	path:hsa05135
ece:Z5100	path:ece05130

ddi

ddi操作搜索 KEGG 药物相互作用数据库，其中提取日本药品标签中指定为禁忌症 (CI) 和预防措施 § 的药物相互作用，通过 KEGG 标识符进行标准化，并用任何可能的分子机制进行注释。

1.https://rest.kegg.jp/ddi/<dbentry>

<dbentry> = Single entry of the following <database>
<database> = drug | ndc | yj

2.https://rest.kegg.jp/ddi/<dbentries>

<dbentries> = Multiple entries in one of the following <database>
<database> = drug | ndc | yj

第一种形式报告所有已知的相互作用：https://rest.kegg.jp/ddi/D00564 。

dr:D00564	cpd:C00304	P	unclassified
dr:D00564	cpd:C01946	P	unclassified
dr:D00564	cpd:C04931	P	unclassified
dr:D00564	cpd:C06624	P	unclassified
dr:D00564	cpd:C07005	P	unclassified
...

而第二种形式可用于检查给定药物组中的任何药物对是否为 CI 或 P：https://rest.kegg.jp/ddi/ndc:0078-0401 。

ndc:0078-0401	ndc:0703-5656	P	unclassified
ndc:0078-0401	ndc:0143-9510	P	unclassified
ndc:0078-0401	ndc:0143-9511	P	unclassified
...

Rpackge for KEGG

我们有时候肯定还是想用代码来完成KEGG的查询或者下载的，上面给的API用爬虫其实就很好访问，但也有一些现成的R包帮忙完成且更加简便。

KEGGREST

KEGGREST 允许访问 KEGG REST API。由于 KEGG 于 2012 年 12 月 31 日禁用了 KEGG SOAP 服务器（这意味着 KEGGSOAP 包将不再工作），因此 KEGGREST 充当替代者。

KEGGREST 的接口比 KEGGSOAP 更简单，并且在某些方面更强大；但是，并非通过 SOAP API 提供的所有功能都已在 REST API 中公开。如果服务器端公开更多功能，则此包将被更新以利用它。

KEGG REST API 基于一些简单的操作构建：info, list, find, get, conv, and link。 KEGGREST 中对应的 R 函数有：keggInfo()、keggList()、keggFind()、keggGet()、keggConv 和 keggLink()。

if (!require("KEGGREST", quietly = TRUE))
    BiocManager::install("KEGGREST")

library(KEGGREST)
# 查看KEGG包含的子数据库
listDatabases()

##  [1] "pathway"  "brite"    "module"   "ko"       "genome"   "vg"      
##  [7] "ag"       "compound" "glycan"   "reaction" "rclass"   "enzyme"  
## [13] "disease"  "drug"     "dgroup"   "environ"  "genes"    "ligand"  
## [19] "kegg"

# 获取KEGG数据库中某个物种的所有通路（如人类）
tmp=keggList("pathway","hsa")
head(tmp)

##                                                 hsa01100 
##              "Metabolic pathways - Homo sapiens (human)" 
##                                                 hsa01200 
##               "Carbon metabolism - Homo sapiens (human)" 
##                                                 hsa01210 
## "2-Oxocarboxylic acid metabolism - Homo sapiens (human)" 
##                                                 hsa01212 
##           "Fatty acid metabolism - Homo sapiens (human)" 
##                                                 hsa01230 
##     "Biosynthesis of amino acids - Homo sapiens (human)" 
##                                                 hsa01232 
##           "Nucleotide metabolism - Homo sapiens (human)"

# 获取某一条KEGG通路的全部信息。
tmp=keggGet("hsa00020")
print(tmp[[1]]$DESCRIPTION)

## [1] "The citrate cycle (TCA cycle, Krebs cycle) is an important aerobic pathway for the final steps of the oxidation of carbohydrates and fatty acids. The cycle starts with acetyl-CoA, the activated form of acetate, derived from glycolysis and pyruvate oxidation for carbohydrates and from beta oxidation of fatty acids. The two-carbon acetyl group in acetyl-CoA is transferred to the four-carbon compound of oxaloacetate to form the six-carbon compound of citrate. In a series of reactions two carbons in citrate are oxidized to CO2 and the reaction pathway supplies NADH for use in the oxidative phosphorylation and other metabolic processes. The pathway also supplies important precursor metabolites including 2-oxoglutarate. At the end of the cycle the remaining four-carbon part is transformed back to oxaloacetate. According to the genome sequence data, many organisms seem to lack genes for the full cycle [MD:M00009], but contain genes for specific segments [MD:M00010 M00011]."

# KEGG通路的基因、代谢物等信息就包含在keggGet()函数获得的结果中

# 获取某一条KEGG通路的全部信息
path <- keggGet("hsa00010")
gene.info <- path[[1]]$GENE
gene.info
genes <- unlist(lapply(gene.info,function(x) strsplit(x,";")))
gene.symbol <- genes[seq(1,length(genes),2)]
gene.id <- genes[seq(2,length(genes),2)]
gene.symbol
# 生成gene symbol和Entrez ID匹配的数据框
data.frame(gene.symbol = gene.symbol,gene.id = gene.id)
通路-基因信息

比如我想要获得人类所有通路-基因信息（参考）

hsa_pathway <- keggList("pathway","hsa")# 获取KEGG数据库中所有人类通路
hsa_path <- data.frame(hsa_pathway) # 转成数据框,方便后续分析
hsa_path$pathID <- rownames(hsa_path) # 提取pathway ID

hsa_gene <- list()
for (i in 1:nrow(hsa_path)) {
    print(hsa_path[i,"pathID"])
    hsa_info <- keggGet(hsa_path[i,"pathID"])
    hsa_gene[[i]] <- hsa_info[[1]]
}

names(hsa_gene)=hsa_path$pathID

pre_gene_in_pathway=function(pathway){
    genes=pathway[["GENE"]]
    if(is.null(genes))return(NULL)
    kegg_gene_id=genes[seq(1,length(genes),2)]
    input_strings=genes[seq(2,length(genes),2)]
    
    data <- data.frame(
        gene = sub(";.*", "", input_strings),
        name = sub(".*;\\s*(.*?)\\s+\\[.*", "\\1", input_strings),
        KO_id = sub(".*\\[KO:(.*?)\\].*", "\\1", input_strings)
        #EC = sub(".*\\[EC:(.*?)\\].*", "\\1", input_strings)
    )
    data=data.frame(pathway_id=pathway$ENTRY,kegg_gene_id=kegg_gene_id,data,row.names = NULL)
    data
}

pre_gene_in_pathway(hsa_gene$hsa00020) 

all_hsa_gene=lapply(hsa_gene,pre_gene_in_pathway)

all_hsa_gene1=do.call(rbind,all_hsa_gene)
rownames(all_hsa_gene1)=NULL

ReporterScore

因为很多富集方法都基于KEGG数据库，所有我写的ReporterScore包中也包含很多下载并处理KEGG数据库的函数。

library(ReporterScore)
#get_org_pathway函数可以获取某个organism的全部通路信息，及每条通路与基因，代谢物的关系。
get_org_pathway(org = "hsa")
#load_*系列函数可以获取KEGG重要模块的层级信息，也可以用update_htable()更新
load_KO_htable()
load_Pathway_htable()
load_Compound_htable()
load_Module_htable()

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Asa12138
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本篇接着介绍下列 4种 api 的用法：getconvlink4.ddiget根据提供的kegg 标识符，返回特定的记录，多个标识符之间用+ 连接，一次最多允许10个标识符，格式如下ht...
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KEGG数据库基本使用
R快速翻译和绘图中文支持
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01-17 1473
在数据分析中，有时候面对大量的英文单词描述可能无法快速获得全部信息，需要去进一步查询或翻译。在R里可以调用一些翻译api完成这一步，但api一般会限制调用速度，`pcutils`提供了一种快速翻译的思路。另外，如何在绘图中展示翻译结果需要考虑中文字体的支持。
kegg Error in clusterProfiler:::kegg_list(“pathway“, species): unused argument (species)
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04-19 848
cluserProfile包更新失败。
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英文名称：(2S)-4-Oxoazetidine-2-carboxylic acid 中文名称：(S)-(-)-4-氧代-2-氮杂环丁烷甲酸 CAS：16404-94-7 MDL NO：MFCD00799571 MF：C4H5NO3 MW：115.09 纯 度：≥97% 结构式： (2S)-4-Oxoazetidine-2-carboxylic acid，16404-94-7标题备注：仅供研究使用。不供人类或兽类使用 供应商：陕西新研博美生物科技有限公司 36476-78-5，3-Az.
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KEGG数据库是生物信息学中一个重要的资源，包含了大量关于基因、蛋白质和代谢途径的信息，对于研究生命科学和疾病机制的研究人员来说是不可或缺的工具。 在JavaScript编程环境中，Node.js以其非阻塞I/O和事件驱动的...
KEGG数据库，除了pathway你还知道哪些
庐州月光的博客
11-09 745
欢迎关注”生信修炼手册”!KEGG称之为京都基因组百科全书，作为一个综合型的数据库，和NCBI类似，它也是有各个子数据库构成的，本文作为一个合集，整理了之前推送的KEGG数据库相关的文章...
Gut Microbes：南医大刘星吟团队揭示肠道微生物谱的改变与孤独症谱系障碍的异常神经递质代谢活动相关
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
04-22 5623
文章目录肠道微生物谱的改变与孤独症谱系障碍的神经递质代谢活动相关导读背景结果研究队列信息表1. 入组研究对象情况表16S rRNA基因测序结果表明孤独症儿童的肠道菌群组成发生改变图1. 16S rRNA测序结果表明健康儿童组（TD）和孤独症儿童组（ASD）的肠道菌群组成存在差异图S1. 非便秘孤独症组（NC-ASD）和健康组（TD）的肠道菌群分析。图S2. 便秘孤独症组（C-ASD）和非便秘孤独症...
Redis基础命令和事务，redis持久化和主从复制
baomingshu的博客
08-31 692
nosql数据库介绍：解释为 non-relational(非关系型数据库)。在NoSQL 数据库中数据之间是无联系的数据的结构是松散的，可变的。优势：大数据量，高性能，灵活的数据模型，高可用，低成本劣势：（1）无关系，数据之间是无联系的。
redis能正常访问，但是springboot编译报错
生而为人我很抱歉
08-27 658
因为你在自定义的 @Configuration 类中没有明确指定配置属性的绑定，或者这个类的加载顺序影响了 Spring Boot 的属性绑定过程。你可以尝试在 MyConf 类上加上 @Order 注解来调整加载顺序，或者确保 MyConf 类不会干扰到 Redis 配置的加载。你可以在 MyConf 类上使用 @ConditionalOnProperty 注解，确保在特定条件下才加载这个配置类，以避免在 Redis 配置加载之前进行不必要的初始化。
python12 中，No module named‘distutils‘错误
qq_43557600的博客
08-27 9907
python12 “ No module named'distutils' ”,​ 安装 pip install setuptools ，解决 ​
（1）Hilt的基本概念和使用
challenge51all的专栏
08-27 1501
Jetpack Hilt 是一个强大的依赖注入框架，它简化了 Android 应用中的依赖管理，提高了代码的可维护性和可测试性。通过使用注解和模块，开发人员可以轻松地管理应用中的依赖关系，并在不同的组件之间共享和注入依赖。在应用的 Application 类上使用这个注解，告诉 Hilt 这是一个使用 Hilt 进行依赖注入的应用。Jetpack Hilt 是一个用于 Android 的依赖注入框架，它建立在 Dagger 的基础上，旨在简化 Android 应用中的依赖注入过程。
数据库管理-第236期 数据库一体机的价值（20240829）
yhw1809的博客
08-29 1218
数据库一体机是硬件、操作系统和数据库之间的融合，利用更少的硬件实现小体积的高性能密度。
SpringBoot项目初始化搭建
weixin_63405049的博客
08-30 871
本章主要讲解了SpringBoot项目初始化搭建，编程事务的使用，分页依赖的使用，以及跨域问题如何解决，解决了轻量级项目构建初期遇到的一些问题，提供于前后端交互时产生的问题进行分析与解决
【MySQL】索引使用规则——（覆盖索引，单列索引，联合索引，前缀索引，SQL提示，数据分布影响，查询失效情况）
最新发布
YYDsis的博客
08-31 729
一.索引使用规则 ※.验证索引效率提升 1.覆盖索引——查询使用了索引，并且需要返回的列，在该索引中已经全部能够找到2.单列索引＆联合索引3.前缀索引——解决冗长字符串与索引问题【1】前缀索引＆索引选择性的介绍【2】前缀索引创建演示：5.SQL提示——指定某个索引/忽略索引/强制索引 6.数据分布影响——MySQL自我评估7.查询失效的几种情况【1】违背——最左前缀法则(联合索引)【2】范围查询右侧失效【3】用or分割开的条件，or后面没索引，所有索引失效【4】索引列上进行运算操作，索引
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