OWKIN-Virtual IHC Staining

Virtual IHC Staining

www.owkin.com/get-in-touch/

Owkin has developed a deep learning data enrichment model that can produce a virtual stain of CD3 from existing haematoxylin and eosin (H&E) whole slide images.

Owkin是一个很有实力的公司,有在做AI医学研究。这里主要介绍将H&E染色图像转变成IHC染色图像这项工作。

接触过病理图像的朋友应该都听说过H&E染色,这在病理学上是十分经典的染色剂,苏木精将细胞核染成蓝色,伊红将细胞外基质和细胞质染成粉红色。病理学家通常将H&E染色与免疫组化染色(IHC)结合,利用抗体与特定抗原结合的原理,有选择地识别组织切片细胞中的抗原。它们可以让病理学家了解图像中特定生物标记物的分布,以帮助确定诊断和进行肿瘤分级。

关于IHC,需要寻找特定抗体,此处选择CD3作为诊断生物标志物。

CD3是一种常见的诊断性生物标志物,它是T细胞活化的辅助受体。CD3免疫染色可检测正常和肿瘤T细胞以及肿瘤微环境的免疫浸润。这种染色具有巨大的预后价值,因为T细胞激活与整体免疫反应有关。然而,免疫染色在回顾性研究或现有数据集中通常是难以获得的。

 

深度卷积神经网络(CNNs)最近已经成为一种重要的图像分析工具。它们加速了病理学家的工作,提高了对患者生存和治疗反应的预测,并在临床发展中识别出新的生物标志物作为潜在的治疗靶点。Owkin开发了一种基于深度学习的数据浓缩模型,可以从现有的H&E染

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C语言是一种广泛使用的编程语言,它具有高效、灵活、可移植性强等特点,被广泛应用于操作系统、嵌入式系统、数据库、编译器等领域的开发。C语言的基本语法包括变量、数据类型、运算符、控制结构(如if语句、循环语句等)、函数、指针等。下面详细介绍C语言的基本概念和语法。 1. 变量和数据类型 在C语言中,变量用于存储数据,数据类型用于定义变量的类型和范围。C语言支持多种数据类型,包括基本数据类型(如int、float、char等)和复合数据类型(如结构体、联合等)。 2. 运算符 C语言中常用的运算符包括算术运算符(如+、、、/等)、关系运算符(如==、!=、、=、<、<=等)、逻辑运算符(如&&、||、!等)。此外,还有位运算符(如&、|、^等)和指针运算符(如、等)。 3. 控制结构 C语言中常用的控制结构包括if语句、循环语句(如for、while等)和switch语句。通过这些控制结构,可以实现程序的分支、循环和多路选择等功能。 4. 函数 函数是C语言中用于封装代码的单元,可以实现代码的复用和模块化。C语言中定义函数使用关键字“void”或返回值类型(如int、float等),并通过“{”和“}”括起来的代码块来实现函数的功能。 5. 指针 指针是C语言中用于存储变量地址的变量。通过指针,可以实现对内存的间接访问和修改。C语言中定义指针使用星号()符号,指向数组、字符串和结构体等数据结构时,还需要注意数组名和字符串常量的特殊性质。 6. 数组和字符串 数组是C语言中用于存储同类型数据的结构,可以通过索引访问和修改数组中的元素。字符串是C语言中用于存储文本数据的特殊类型,通常以字符串常量的形式出现,用双引号("...")括起来,末尾自动添加'\0'字符。 7. 结构体和联合 结构体和联合是C语言中用于存储不同类型数据的复合数据类型。结构体由多个成员组成,每个成员可以是不同的数据类型;联合由多个变量组成,它们共用同一块内存空间。通过结构体和联合,可以实现数据的封装和抽象。 8. 文件操作 C语言中通过文件操作函数(如fopen、fclose、fread、fwrite等)实现对文件的读写操作。文件操作函数通常返回文件指针,用于表示打开的文件。通过文件指针,可以进行文件的定位、读写等操作。 总之,C语言是一种功能强大、灵活高效的编程语言,广泛应用于各种领域。掌握C语言的基本语法和数据结构,可以为编程学习和实践打下坚实的基础。

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