基因组数据分析软件Sentieon发布202112.02版本更新

最新推荐文章于 2022-04-21 09:49:35 发布

毅硕科技

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分类专栏： Sentieon 文章标签：生物信息学大数据机器学习 hpc python

本文链接：https://blog.csdn.net/bio2s/article/details/123996225

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Sentieon 软件忠于BWA、GATK、MuTect、MuTect2、STAR、Minimap2等金标准的数学模型，在保证完全匹配开源分析方案结果的前提下，计算效率提升15倍以上。Sentieon为大群组项目提供一站式Joint Calling解决方案，可同时处理10万个WGS样本的Joint Calling，无需中间步骤。大幅提升WGS/WES/Panel/ctDNA/RNA等基因数据NGS分析效率和计算精度。
Sentieon Release
根据用户的需求与反馈，持续迭代改进Sentieon软件包。2022年4月2日，Sentieon推出了最新的202112.02版本：

升级了DNAscope的机器学习模型模块；
进一步提升了Sentieon BWA在某些ARM架构CPU平台上的计算效率；
添加了对多个测序平台的许可框架支持；

除此之外，Sentieon 202112.02版本软件，还对前一个版本的bug进行了修复。

新添加功能

A license framework to support multiple sequencing platforms.
Improved bwa-mem speed on certain ARM CPU.

新添加功能

Solved issue in GVCFtyper that would produce no-calls in certain ploidies when input is a multi-sample merged gVCF from third party tool.
Solved issue in DNAscope that could produce no call at zero coverage site when using --given.
Solved issue that triggered CRAM buffer overflow when minimap2 output zero-length secondary reads
Solved issue in minimap2 that would cause the job to hang under rare circumstances.

Sentieon 新版手册及安装包下载链接
 Sentieon 中文介绍