【NGS分析工具】Sentieon软件常见问题列表(持续更新...)

Sentieon软件提供高效且与GATK匹配的NGS分析,适用于遗传变异、体细胞变异和肿瘤研究。本文整理了Sentieon的下载、中文支持、与GATK对应模块、pipeline脚本、功能问题等常见问题,帮助用户快速上手。Sentieon功能如DNAscope、UMI分析和BQSR等,针对不同场景有特定使用建议。
摘要由CSDN通过智能技术生成

Sentieon软件忠于BWA、GATK、MuTect、MuTect2、STAR、Minimap2金标准的数学模型,在保证结果完全匹配GATK/BWA金标准的前提下,分析效率提升10倍以上。Sentieon为大群组项目提供一站式Joint Calling解决方案,最大可处理10万个WGS样本的Joint Calling,无需中间步骤。为了方便用户自定义BAM流程,Sentieon提供了Python API Engine。提供UMI模块,替代Fgbio/picard,在更高精度的条件下UMI分析速度提升20倍。提供替代STAR的加速模块,为单细胞测序RNA-seq提供加速计算。

@毅硕科技 整理了日常测试-试用Sentieon软件过程中常见问题的解答列表,方便大家更快速的上手Sentieon软件,应用于遗传变异、体细胞变异、肿瘤NGS分析等方向。


Sentieon软件常用的链接

Q: 请问我去哪里下载Sentieon软件和手册?

A: 您可以到以下链接下载最新版的Sentieon软件和使用手册?
https://share.weiyun.com/HzAXQoGH

Q: 请问有中文的软件技术支持吗?

A 您可以登录一下网站了解Sentieon软件的中文支持:
https://www.insvast.com/sentieon

Q: 请问Sentieon的模块和GATK模块有哪些版本对应:

A: 关于这个问题,您可以访

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