C语言读取文件(一)——再谈如何求某一列的平均值

最新推荐文章于 2024-09-21 00:09:11 发布

生信了（公众号同名）

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分类专栏： # C 文章标签： C语言生物信息算法

本文链接：https://blog.csdn.net/biocity/article/details/91895624

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本文对比了C语言中fgetc、fgets、fread和fscanf等函数在读取文件和计算某列平均值时的效率，结果显示fread效率最高，fgetc最低。同时提供了处理EOF问题的代码示例。

摘要由CSDN通过智能技术生成

原创: hxj7

本文粗浅比较了C语言中常用的几种读取文件的函数的效率，并给出了几段求取某列平均值的代码。

第一部分：比较读取文件的效率

在之前的文章《生信（五）awk求取某一列的平均值》中，笔者曾经给出过C语言求取某列平均值的代码，但是最近回顾时发现，这段代码至少有几点不足：

1. 利用 fgetc 函数来读取文件，现在看来效率不高。
2. 如果文件最后没有一个空白行的话，会陷入无限循环。也就是对 EOF 的处理不完善。

大家都知道，C语言读取文件的常用函数有 fgetc、fgets、fread 以及 fscanf 等。笔者曾经一度以为就读取文件的效率而言，fgetc 不亚于其他函数。但是究竟是不是这样，还是自己验证一下让自己信服。
首先随机生成一个文件，1000万行，4列（该文件下面还会用到）。我们看一下上述函数读取文件的效率：
在这里插入图片描述
从上图中可以看出，fread 的效率最高，fgetc 的效率最低。当然这种比较很粗浅，但是能大概看出趋势。
各个函数读取文件的代码如下：其中 main 函数是一样的，只是 readFile 函数的实现不同。

    #include <stdio.h>
    #include <stdlib.h>
    #include <time.h>
    #define BUFSIZE 4096
    
    void readFile(FILE* fp);
    
    int main(int argc, char* argv[]) {
   
      FILE *fp;
      time_t start, end;
      start = time(NULL);
      if (argc < 2) {
   
        printf("Usage: %s <filename>\n", argv[0]);
        return 1;
      }
      if ((fp = fopen(argv[1], "r")) == NULL) {
   
        printf("Error: cannot open file\n");
        return 1;
      }
      readFile(fp);
      fclose(fp);
      end = time(NULL);
      printf("time spent: %d seconds\n", end - start);
      return 0;
    }
    // readFile_fgetc:
    void readFile(FILE* fp) {
   
      char c;
      while ((c = fgetc(fp)) != EOF)
        ;
    }
    // readFile_fgets:
    void readFile(FILE* fp) {
   
      char buf[BUFSIZE];
      while (fgets(buf, MAXLINE, fp) != NULL)
        ;
    }
    // readFile_fread:
    void readFile(FILE* fp) {
   
      char buf[BUFSIZE];
      while (fread