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我是大南瓜
个人学习笔记
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读书笔记--- ggplot2:数据分析与图形艺术
ggplot2:数据分析与图形艺术原创 2023-01-15 22:21:07 · 565 阅读 · 0 评论 -
R包WGCNA---转录组WGCNA共表达网络构建(基本概念)
R包WGCNA---转录组WGCNA共表达网络构建(基本概念)原创 2022-11-06 23:29:33 · 1717 阅读 · 2 评论 -
R包WGCNA---转录组WGCNA共表达网络构建(无表型计算提取网络)
R包WGCNA—转录组WGCNA共表达网络构建(无表型信息)最近有一个需求,需要使用多个分组的RNA-seq数据(包含CK在内共30个处理)进行共表达网络构建。将网上搜索的资料整理如下,作为记录。1. 下载R包WGCNA目前,共表达网络构建通常使用WGCNA这个R包,下载的时候按照官方文档即可。下载:当然也可以选择当前版本的R下继续安装,这就需要手动安装很多R包,最终完成安装,官网中也有相关的方法介绍。如果使用的Mac OS X系统,有时安装失败,也要重新安装才行【1】。为了方便,我选择cond原创 2022-04-08 15:38:29 · 6060 阅读 · 8 评论 -
R语言---Ubuntu中R语言更新至R4.2.1和R包devtools下载
R语言---Ubuntu中R语言更新至R4.2原创 2022-10-23 14:23:55 · 5290 阅读 · 0 评论 -
读书笔记---R数据可视化手册(R Graphics Cookbook)
读书笔记---R数据可视化手册(R Graphics Cookbook)原创 2022-10-21 15:55:06 · 337 阅读 · 0 评论 -
R语言---ggplot图片边缘空白设置和ggplot映射的shape值多余6个
R语言---ggplot图片边缘空白设置原创 2022-10-17 22:41:48 · 4119 阅读 · 0 评论 -
R语言---PCA/tSNE/UMAP降维计算
R语言---PCA/tSNE/UMAP降维计算原创 2022-09-14 23:06:28 · 4948 阅读 · 0 评论 -
R语言---scale函数,match函数和%in%详解
R语言---scale函数,match函数和%in%详解原创 2022-09-11 15:48:51 · 3536 阅读 · 4 评论 -
R语言ggplot2添加单个文本或多个文本(包括公式)
R语言ggplot2添加单个文本或多个文本原创 2022-09-08 10:23:04 · 12390 阅读 · 0 评论 -
R语言在散点图中添加lm线性回归公式
R语言在散点图中添加lm线性回归公式原创 2022-09-05 21:20:40 · 7542 阅读 · 0 评论 -
R语言ggplot2 title设置(main, axis 和 legend titles)
R语言ggplot2 title设置(main, axis 和 legend titles)原创 2022-09-05 17:03:13 · 22456 阅读 · 0 评论 -
相关系数pearson、spearman、kendall和R语言中的cor/or.test()
相关系数pearson、spearman、kendall和R语言中的cor/or.test()原创 2022-09-04 21:48:22 · 4453 阅读 · 0 评论 -
R包rdist、Python sklearn计算pairwise distance
pairwise distance原创 2022-08-07 23:16:25 · 1445 阅读 · 2 评论 -
R语言ggplot2循环中保存图片失败问题
R语言ggplot2循环中保存图片失败问题原创 2022-08-02 21:24:05 · 2386 阅读 · 0 评论 -
R语言---颜色选择和设置
在使用R绘图调色的时候,每次都要选择很久,有时候也会忘记相关的记录,特此总结一些自己常用的。原创 2022-07-15 11:27:38 · 23859 阅读 · 3 评论 -
安装Rstudio Desktop和Rstudio Server免费版本
安装Rstudio Desktop和Rstudio Server免费版本原创 2022-06-20 15:16:00 · 3259 阅读 · 0 评论 -
R语言---将对称方阵转换为两两对应的关系
R语言—将对称方阵转换为两两对应的格式1. 需求描述有时候会有矩阵( n*n)转换为两两对应关系的需求,例如:Row/ColumnABCA123B234C340可以看到上面的方阵是右上角和左下角对称的,这样的数据可以转换为两两关系,这样更清晰,也能更好的适应一些软件,上面的方阵可以转换为下面的六行数据:Column1Column2ValueAA1AB2AC3BB3BC4原创 2022-03-22 16:31:21 · 2024 阅读 · 4 评论 -
R语言---下载R包提示00LOCK-dplyr解决
R语言—下载R包提示00LOCK-dplyr解决1.遇到问题(R版本3.5.1)在使用其他软件的时候会调用R包dplyr,当时提示这个软件包版本不够,会影响其他软件的使用。因此需要升级这个R包,当时想的是删除当前版本,然后下载一个新的版本。使用remove.packages("dplyr")删除,之后下载使用install.packages("dplyr"),报错如下:ERROR: failed to lock directory ‘/data/cfc424_data/biosoft/minicon原创 2022-03-16 11:12:27 · 3448 阅读 · 0 评论