VASP四大输入文件——POSCAR，POTCAR

最新推荐文章于 2024-11-03 17:27:42 发布
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分类专栏： VASP 输入文件 POSCAR
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本文介绍了VASP模拟中的两个关键输入文件：POSCAR和POTCAR。POSCAR详细解析了格子参数、原子坐标和类型，而POTCAR涉及赝势选择，如PBE泛函、价电子数和截断能等。通过grep命令，用户可以方便地查找和筛选所需信息。

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POSCAR

例子：把一个H原子放在一个10 10 10的格子中

第一行：H atom    #第一行随便写，不能没有

第二行：1.0          #缩放系数 

第三行：10.0 0.0 0.0   

第四行：0.0 10.0 0.0  

第五行：0.0 0.0 10.0   

第六行：H           # H原子

第七行：1            #H原子的数目 

第八行：cart         #笛卡尔坐标cart，分数坐标direct

第九行：0 0 0         #H原子位置 

POSCAR详解

  • 第一行：随便写，不能没得

  • 第二行：格子的缩放系数，在优化晶格常数的时候，这个很重要

  • 第三~五行：组成格子的坐标信息，从原点出发，单位为Å

  • 第六行：体系的元素符号

  • 第七行：相对于第六行，对应的元素原子的个数

  • 第八行：原子坐标的表示形式，有两种，一种是笛卡尔坐标(Cartesian),一种是分数坐标(Direct),二者的区别是从原子的坐标行开始，故从第八行开始改变，如果想改成分数坐标，则可以把第八、九行分别改变。笛卡尔坐标并不是原子在我们作为参考的直角坐标系中的绝对位置，而是在元胞基矢构成坐标系中，原子的绝对位置&

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POSCAR文件是VASP软件中定义系统结构的关键输入文件。正确设置和修改POSCAR文件对于材料计算至关重要。通过使用结构分析软件、编写脚本和利用VASP工具，可以高效地生成和修改POSCAR文件。选择性动力学功能可以在需要固定某些原子的情况下使用，以实现更精确的计算控制。希望本节内容对您理解和使用POSCAR文件有所帮助。如果有更多问题，欢迎随时咨询。
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kkchenjj的博客
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在 VASP 计算中，POTCAR文件是一个非常重要的输入文件，它包含了材料计算所需的伪势信息。伪势（Pseudopotential）是一种简化的真实原子势场的方法，用于描述电子与原子核之间的相互作用。POTCAR文件由多个伪势文件组合而成，每个伪势文件对应一种特定的元素。在进行 VASP 计算之前，必须生成一个包含所有参与计算的元素的POTCAR文件。POTCAR文件是 VASP 计算中不可或缺的输入文件，它包含材料计算所需的伪势信息。生成POTCAR文件的方法包括手动组合和使用脚本自动组合。
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VASP新手入门，远程超算提交——1 准备文件
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推荐使用.xsd文件，它是MS自己的3D模型文件格式，通过它生成的POSCAR文件保留了原子是否被固定的信息，这是其他方法不具有的。方法一：直接从MS中保存出.cell文件，再直接在.cell文件基础上改名字，修改其中的内容，获得POSCAR文件，此方法需要自己手动修改，比较麻烦。第三、四、五行为晶格矢量a1, a2, a3，即组成格子的三条边的矢量坐标信息，缩放系数就在这里起作用，这三个矢量就是用来确定元胞的基矢。第六、七行为元素名字和对应原子数量，此处表示有28个As原子，22个Ga原子，8个H原子。
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votetrump的博客
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vasp
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### VASP 软件简介及其使用方法 VASP（Vienna Ab initio Simulation Package）是一种用于材料科学领域中的量子力学分子动力学模拟程序包[^3]。它基于密度泛函理论（DFT），采用平面波基组和赝势来计算晶体、表面以及纳米系统的电子结构属性。VASP 的核心功能在于解决薛定谔方程，从而预测原子间相互作用力并优化几何构型。 #### 主要特点 VASP 支持多种交换关联函数形式，例如 LDA (Local Density Approximation) 和 GGA (Generalized Gradient Approximation)[^4]。这些选项使得研究者能够根据不同体系的需求调整精度与效率之间的平衡。此外，VASP 还提供了混合泛函的支持，这对于描述带隙材料尤为重要。 #### 安装与配置 由于版权原因，VASP 并未提供开源版本；用户需通过官方网站申请授权许可后下载二进制文件或源码自行编译安装[^5]。典型设置过程涉及指定 MPI 编译器路径、Fortran/C 库链接参数以及其他硬件特定优化选项。 以下是简化版 Linux 下的 Makefile 配置片段作为参考： ```makefile # Example of setting up VASP on a typical HPC environment PROGRAM=vasp_std FC=gfortran FFLAGS=-O2 -fopenmp LDFLAGS=-lblas -llapack INCS= LIBS= ``` 运行时通常建议利用作业调度系统提交批量任务脚本至高性能集群节点执行。下面展示了一个 SLURM 系统上的 sbatch 文件模板： ```bash #!/bin/bash #SBATCH --job-name=vacancy_analysis #SBATCH --nodes=1 #SBATCH --ntasks-per-node=20 #SBATCH --time=24:00:00 #SBATCH --partition=compute module load vasp/6.1.0 intelmpi/2019u5 srun vasp_std > output.log ``` #### 输入输出解析 输入数据主要包括 INCAR 控制变量设定、KPOINTS k-空间采样网格定义、POSCAR 初始坐标信息以及 POTCAR 原子种类对应的伪势库选取。而标准输出 OUTCAR 及 XML 格式的 vasprun.xml 中则记录了每一步迭代的能量变化趋势、应力张量分量等重要物理化学性质指标[^6]。
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