Materials Studio建模之初阶

最新推荐文章于 2025-02-01 22:33:35 发布
最新推荐文章于 2025-02-01 22:33:35 发布
阅读量3.4k 收藏 21
点赞数 2
分类专栏： 建模
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/chenlanlan_10/article/details/119580171
版权
本文介绍了如何使用Materials Studio软件进行氯化钠晶体结构的建模。通过两种方法，即从库导入和手动搭建，详细阐述了创建晶格模型的步骤，包括设置晶格参数、添加原子、查看晶体性质等。此外，还提及了调整3D显示形式和转换为最简单位胞的操作，为初学者提供了清晰的教程。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

本文转载于，微信公众号，VASP学习交流，将会持续更新

  • 新建工程：打开Materials Sautio会问是要开始一个新project还是打开一个以前的

  • 选开启新的project，现在以氯化钠为例，以NaCl为名称

图片

图片

注意：不要保存在C盘，不要用中文命名

视窗介绍——三个 Explorer

  • 从View的Explorer可见：Job Explorer、Project Explorer、Properties Explorer

图片

  • Job Explorer ，己完成的、正在跑的；显示运行的job，近端远程的状态都可以显示

  •  Project Explorer ，各种输入与输出文件，可以查看结果、修改输出入的相关设定；

  • Properties Explorer 

最低0.47元/天 解锁文章
材料仿真软件：Materials Studio_（6）.分子结构建模
kkchenjj的博客
02-26 1205
分子结构建模是材料仿真中的基础步骤，Materials Studio提供了多种工具和模块来帮助用户高效、准确地完成这一任务。从简单的分子构建到复杂的电子结构分析，Materials Studio的功能覆盖了材料仿真中的各个方面。通过本文的详细介绍和代码示例，希望用户能够更好地理解和使用Materials Studio进行分子结构建模和分析。
Materials Studio建模——异质结的建立（2）
chenlanlan_10的博客
08-17 7366
本文转载于，微信公众号，VASP学习交流，将会持续更新 这里以ZnO(111)和MoS2（001）组成的异质结为例继续巩固异质结的建立过程 1. 分别从MS库导出ZnO和MoS2的结构 2. 切ZnO(001)面build——surface——cleave surface 建立真空层，这里15埃build——crystal——build vacuum slab 同样的方法得到MoS2(001) 3. 建立异质结，有两种方法，第一种是将框子摆正，复制一层到另一层，微小差别可以用moveme
【MS】 Materials studio查看原子之间的距离和角度
最新发布
haoweixl的博客
02-01 509
点选任意2个原子 会显示二者距离(单位为埃)点击图中下三角打开下拉框后 选择。
【Materials Studio】入门基础篇
haoweixl的博客
12-25 1万+
经典的分子模拟过程构建模型;设置计算参数;运行计算;分析与展示计算结果。完成上述4个步骤，即完成了一次分子模拟。
Material Studio中分子动力学模拟得到密度density和溶解度参数
handsome213的博客
07-22 4544
使用sketh工具画出全原子分子，以异辛烷为例子。
Material studio切胞操作
qq_42168543的博客
12-29 1万+
Materials studio进行切胞操作： 以以下结构为例 沿其001晶面切胞 选择build > surface > cleave surface 输入晶面 0 0 1， 点击cleave, 则沿着晶格的(001)晶面进行切割 效果： 可见切割后的结构是没有"封顶"的，需要手动设置一个真空层： build > crystal > build vacuum slab.. 在弹窗中输入真空层厚度（这里设置为10埃）： 注意细节：这里真空层设..
Materials-Studio建模操作详细步骤(本人原创)1
08-03
《Materials Studio建模操作详解》 Materials Studio是一款强大的材料科学模拟软件，广泛应用于化学、物理、材料工程等领域。本文将详细介绍Materials Studio的建模操作，包括启动、创建项目、输出图像、自动保存...
中科大material studio 教程_materialsstudio_materialstudio_教程
09-11
《材料科学与Materials Studio软件深度探索教程》 Materials Studio是一款由Accelrys公司开发的强大分子模拟软件，广泛应用于材料科学、化学、物理等领域的研究。它集成了多种计算方法，如量子力学、经典力学、分子...
Materials Studio-VESTA教程v1.41
08-08
Materials Studio 和 VESTA 是两种在晶体建模领域广泛应用的专业软件。它们被广泛用于研究晶体结构、材料性质预测以及分子模拟。本教程基于 Materials Studio v8.0 和 VESTA v3.3.8，适用于 Windows 7 64 位操作系统...
Materials Studio建模与材料模拟计算工作站方案2022
Su_wenfeng的博客
02-08 8349
（一）Materials Studio材料模拟软件介绍 Materials Studio（简称MS）是分子模拟领域内的多种模拟方法以及建模可视化性质分析工具。提供三维结构模型，对各种晶体、无定型以及高分子材料的性质及相关过程进行深入的研究。可以从电子、原子以及高分子的角度去分析物质的结构与性质 利用的主要方法为：以密度泛函为主的量子力学模拟方法、分子力学和分子动力学模拟方法、蒙特卡罗模拟法、介观动力学(MesoDyn)和耗散粒子动力学（DPD）、统计方法QSAR等多种先进算法和X射线衍射分析等仪器分析方法，
计算机材料设计Materials-Studio教程（基础版）——初识Materials-Studio
qq_64441210的博客
11-13 5081
计算机材料设计Materials-Studio教程（基础版）——初识Materials-Studio
Materials Studio教程(中科大)
热门推荐
懒散的鱼与消失的猫
05-22 7万+
目录 第0章 绪论 10.1 计算机材料设计的概念 10.2 计算机材料设计的发展 10.3 计算机材料设计的途径 2第1章 快速启动教程 11.1 创建项目(Creating a project) 11.2 打开、浏览3D文档 21.3 绘制苯甲酰胺(benzamide)分子 41.4 用学习表文档进行浏览和工作 81.5 研究分子晶体：尿素 111.6 建立α-quartz晶体 121...
Materials Studio选中一类元素下所有原子
qq_42168543的博客
05-01 1万+
使用Materials Studio时遇到一个问题 想要把结构中所有的S原子半径缩小显示 几乎把菜单栏找了个遍 在MS官网上也搜了 无果 初始结构 转变思路，欲将结构中所有的S原子半径缩小显示，如果有方法选中该元素下的所有原子，那问题就基本解决了 最终在MS上找到了以下按钮: edit > atom selection 以下： 一目了然 选中了这些原子之后 问题就解决了 display style > ball redius > 修改显示半径 : 与第一张图相..
Materials studio查看原子之间的距离和角度
qq_42168543的博客
12-28 2万+
步骤：- view > toolbars > sketch : 从而调出如下的工具栏： 点击图中下三角打开下拉框后 选择distance 点选任意2个原子 会显示二者距离(单位为埃) 同样的，测量角度则选择下拉框中Angle, 之后点击任意3个原子 会显示相应的角度: ...
Linux 下运行Dmol3,Materials Studio
weixin_34297334的博客
04-30 2227
Materials Studio 2021新版本发布！Materials Studio 2021增加一系列面向产品研发的新功能，进一步扩展了在热门研究领域的应用能力，包括在新功能材料和能源材料方面。Materials Studio新增功能• 新模块FlexTS，FlexTS为DMol3和DFTB+提供了在势能面上找到固定的任务功能，使计算反应路径和与化学反应相关的能垒成为可能。•Material...
MS & Materials Studio 安装
sinat_41351675的博客
07-17 5万+
MS & Materials Studio 安装 欢迎来到我的博客！坚持比努力重要。 文章目录MS & Materials Studio 安装 欢迎来到我的博客！坚持比努力重要。目录1.安装包2. 注意事项3.卸载流程4.安装流程5.打开软件运行流程 目录 1.安装包 链接：https://pan.baidu.com/s/1JkbivtgrmTZKwgFgeDCxnw 提取码：njna 2. 注意事项 - 1.本次提供安装包是2019， 它兼容了2017等之前版本的错误 2.安装路
Material studio(MS）软件介绍及其应用的领域
weixin_44873868的博客
01-27 1万+
Material studio能方便的建立三维结构模型，并对各种晶体、无定型以及高分子材料的性质及相关过程进行深入的研究。可以从电子、原子以及高分子的角度去分析物质的结构与性质。 图1 水分子在不同键长，键角下得能量值，以及相对应的模型 利用的主要方法为：以密度泛函为主的量子力学模拟方法、分子力学和分子动力学模拟方法、蒙...
materials studio PVDF建模
01-07
### 创建PVDF模型的具体方法 在Materials Studio中创建聚偏氟乙烯(PVDF)模型的过程涉及多个具体操作。为了构建PVDF模型，需先启动Materials Studio软件并新建项目。 #### 新建3D原子文档 在Project Explorer窗口内，于`untitled`上点击鼠标右键选择`New -> 3D Atomistic Document (.xsd)`来创建用于保存材料结构的新文件[^1]。此XSD文件将成为后续所有编辑工作的基础平台。 #### 寻找或绘制PVDF分子链 对于PVDF这类聚合物而言，可以通过两种方式获取其初始结构： - **内置数据库查找**：尝试通过Materials Studio自带的化学物质库搜索已有的PVDF单元。 - **手动搭建**：如果未能找到现成模板，则可借助Builder模块中的工具逐一放置碳(C)、氢(H)以及氟(F)原子，并按照正确的连接顺序形成重复单元(-CH2-CF2-)n。 #### 构造无限周期性结构 一旦拥有了单体片段之后，便能运用Polymer Builder功能将其沿特定方向复制扩展成为具有宏观长度的一维线型高分子链；再经由适当调整相邻链间距离与角度关系进而组装成立方晶胞内的二维层状或多维度网络架构形式。 #### 参数优化与验证 完成初步构型设计后，应当采用Forcite或其他合适的力场模拟器执行几何最优化过程以确保所得模型处于能量最低状态。最后还需仔细核对各项物理性质参数是否合理准确无误。 ```matlab % 这里提供一段伪代码示意如何调用Materials Studio API实现自动化流程的一部分 ms = init_materials_studio(); % 初始化MS环境接口对象 project = ms.new_project('pvdf_model'); % 建立新工程实例命名为'pvdf_model' document = project.create_3d_atomistic_document(); % 添加空白三维原子级描述符节点至当前活动区 polymer_unit = document.import_structure_from_database('PVDF Unit Cell'); % 尝试从本地资源索引加载目标化合物原型数据集 if isempty(polymer_unit) polymer_unit = document.build_polymer_manually(['C', 'H', 'F']); % 备选方案——人工拼接指定元素构成的基础节段 end extended_chain = extend_polymer_along_axis(polymer_unit, [0, 0, 1], n_units); % 沿Z轴拉伸增长为连续长链形态,n_units表示重复次数 optimized_structure = optimize_geometry(extended_chain); % 应用力学算法精修整体布局直至收敛稳定 save_as_cif_file(project, optimized_structure, 'final_pvdf.cif'); % 输出最终成果为标准晶体交换格式文件供进一步分析处理使用 ```
评论 1
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值