【云计算虚拟化】基于docker的caffe环境搭建

引言

为什么要用docker, 熟悉docker 其实已经很久了,自从实习的时候觉得它是一个利器以来一直没有机会使用它,这几天在折腾caffe环境中,觉得是时候用上Docker了。

需求:构建一个独立的容器,里面安装了caffe 的所有依赖,在需要跑代码的时候,直接运行它。

优点:可以解决各种依赖问题,比如这个软件需要安装gcc 4.7 ,而另外一个需要安装gcc 4.8 等等互斥的环境需求。

Docker 安装

docker 的安装和基本使用,可以参照我上面的两篇博客:安装篇使用篇

构建镜像

构建镜像有两种方法:

1,写Dockerfile,优点是便于共享;

2,从容器中commit,优点是简单方便,但是不方便共享。

由于安装caffe环境需要众多的依赖包,而且由于网络方面的原因,这些依赖包往往不能一次够装好,为了方便起见,这里直接启动一个基本的容器,然后从里面安装依赖包。

这边选择基本的ubuntu:14.04 来开始构建环境,

1,启动容器:

sudo docker run --dns 8.8.8.8 --dns 8.8.4.4 --name ubuntu_caffe -i -t ubuntu:14.04 /bin/bash

需要更改dns,是因为如果没有的话,容器上不了网。

2,依赖包安装

进入容器之后,所有的操作就跟普通的一个样了。
首先安装一些基本的工具:

apt-get install wget
apt-get install unzip
apt-get install python-pip

新建路径,后面所有的caffe代码都放在这里

mkdir /home/crw/Caffe
cd /home/crw/Caffe

opencv 的安装:
github上面有一个一键安装的,但是在容器里面一键安装不了,后面我是把它里面的脚本一句一句的搞出来执行。

#opencv一句一句的运行
arch=$(uname -m)
if [ "$arch" == "i686" -o "$arch" == "i386" -o "$arch" == "i486" -o "$arch" == "i586" ]; then flag=1; else flag=0; fi
echo "Installing OpenCV 2.4.9"
mkdir OpenCV
cd OpenCV
sudo apt-get -y install libopencv-dev
sudo apt-get -y install build-essential checkinstall cmake pkg-config yasm
sudo apt-get -y install libtiff4-dev libjpeg-dev libjasper-dev
sudo apt-get -y install libavcodec-dev libavformat-dev libswscale-dev libdc1394-22-dev libxine-dev libgstreamer0.10-dev libgstreamer-plugins-base0.10-dev libv4l-dev
sudo apt-get -y install python-dev python-numpy
sudo apt-get -y install libtbb-dev
sudo apt-get -y install libqt4-dev libgtk2.0-dev
sudo apt-get -y install libfaac-dev libmp3lame-dev libopencore-amrnb-dev libopencore-amrwb-dev libtheora-dev libvorbis-dev libxvidcore-dev
wget http://archive.ubuntu.com/ubuntu/pool/multiverse/f/faac/faac_1.28-6.debian.tar.gz
vi /etc/hosts
ifconfig
sudo apt-get -y install x264 v4l-utils ffmpeg
wget -O OpenCV-2.4.9.zip http://sourceforge.net/projects/opencvlibrary/files/opencv-unix/2.4.9/opencv-2.4.9.zip/download
unzip OpenCV-2.4.9.zip
cd opencv-2.4.9
mkdir build
cd build
cmake -D CMAKE_BUILD_TYPE=RELEASE -D CMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr/local -D WITH_TBB=ON -D BUILD_NEW_PYTHON_SUPPORT=ON -D WITH_V4L=ON -D INSTALL_C_EXAMPLES=ON -D INSTALL_PYTHON_EXAMPLES=ON -D BUILD_EXAMPLES=ON -D WITH_QT=ON -D WITH_OPENGL=ON ..
make -j4
sudo make install
sudo sh -c 'echo "/usr/local/lib" > /etc/ld.so.conf.d/opencv.conf'
sudo ldconfig
cd ..

caffe 和python依赖包:

sudo apt-get install libprotobuf-dev libleveldb-dev libsnappy-dev libopencv-dev libhdf5-serial-dev protobuf-compiler
sudo apt-get install --no-install-recommends libboost-all-dev
sudo apt-get install libgflags-dev libgoogle-glog-dev liblmdb-dev
sudo apt-get install libatlas-base-dev

安装cuda:
这里面个小技巧就是,如何从host 主机导入数据到容器中,可以使用如下命令(在host上运行)


sudo cp cuda_7.5.18_linux.run /var/lib/docker/aufs/mnt/92562f161e51994949dd8496360265e5d54d32fbe301d693300916cd56d4e0a2/home/crw/Caffe

sudo cp cudnn-7.0-linux-x64-v3.0-prod.tgz /var/lib/docker/aufs/mnt/92562f161e51994949dd8496360265e5d54d32fbe301d693300916cd56d4e0a2/home/crw/Caffe

sudo cp caffe-master.zip /var/lib/docker/aufs/mnt/92562f161e51994949dd8496360265e5d54d32fbe301d693300916cd56d4e0a2/home/crw/Caffe

其中,那一长串数字,是你的容器的完全id,可以用命令

docker inspect -f   '{{.Id}}' ubuntu_caffe #ubuntu_caffe 是容器的名字
./cuda_*_linux.run -extract=`pwd`
./NVIDIA-Linux-x86_64-*.run -s --no-kernel-module
./cuda-linux64-rel-*.run -noprompt

安装cudnn:

tar -xvf cudnn-7.0-linux-x64-v3.0-prod.tgz 
cp cuda/include/cudnn.h /usr/local/cuda/include/
cp cuda/lib64/* /usr/local/cuda/lib64/

安装caffe:

cd caffe-15.12.07/
cp Makefile.config.example Makefile.config
vi Makefile.config
make all
make test

安装caffe 的python绑定

cd python/

apt-get install python-pip
for req in $(cat requirements.txt); do pip install $req; done

sudo apt-get install python-numpy python-scipy python-matplotlib ipython ipython-notebook python-pandas python-sympy python-nose

下面这几个包需要手动自己去装,用上面的命令一直装不好。

apt-get install python-scipy
for req in $(cat requirements.txt); do pip install $req; done
pip install -U scikit-learn
for req in $(cat requirements.txt); do pip install $req; done
pip install scikit-image
for req in $(cat requirements.txt); do pip install $req; done

然后

make pycaffe

最后,
新建一个路径,以便于磁盘映射

mkdir /media/crw/MyBook

所有的环境都做好了之后,就可以commit 了

docker commit 92562f161e519 my-ubuntu-caffe

这样,就在本地环境中,制作好了一个转好caffe gpu环境的容器了。

启动caffe启动容器:

sudo docker run -ti \
    --device /dev/nvidia0:/dev/nvidia0 \
    --device /dev/nvidiactl:/dev/nvidiactl \
    --device /dev/nvidia-uvm:/dev/nvidia-uvm \
    -v /media/crw/MyBook:/media/crw/MyBook \
    my-ubuntu-caffe  /bin/bash

1,显卡直通使用,
2,文件映射,挂载一个host主机的磁盘到容器路径下,这里设置为相同,可以减少一些不必要的麻烦。

运行caffe模型训练

会有提示说找不到cuda啥的,设置一下环境变量即可。

$ export CUDA_HOME=/usr/local/cuda
$ export LD_LIBRARY_PATH=${CUDA_HOME}/lib64
$ PATH=${CUDA_HOME}/bin:${PATH}
$ export PATH
cd /media/crw/MyBook/Experience/FaceRecognition/Softmax/try3_3
./train.sh

Done~

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