‘h5py/h5t/H5PY_OBJ.pxd‘ not found

1 背景

这个问题是在安装arm机器上编译好的python包tensorflow==2.6.5的wheel文件遇到。

背景是官方tensorflow==2.6.5没有提供arm架构的包，无法使用pip安装，因此需要在arm机器上自己编译wheel文件。而在安装编译好了的wheel文件的时候，pip会安装依赖，包括h5py这个包，pip会编译h5py包，从而导致错误。如下：

2 原因

官方的解释是h5py低版本只能用Cython==0.29.xx版本编译，不能用3.xx.xx版本，否则会导致编译错误。

参考：https://github.com/h5py/h5py/issues/2300

3 解决办法

既然Cython版本不对，那么思路就是编译h5py的时候指定正确Cython版本，刚开始在安装tensorflow之前，先提前安装指定版本的Cython库，发现仍然还有问题，提前安装的Cython不生效。pip在编译安装的时候，会在独立的环境中拉去Cython，也就是说我们通过pip提前安装Cython是无意义的。

正确办法：

我们发现安装tensorflow==2.6.5的时候，安装的h5py依赖版本是3.1.0，我们从h5py-3.1.0.tar.gz下载h5py的源码包，将源码包解压，打开setup.py文件，如下：

我们发现这里定义了安装时依赖的Cython版本。在Cython 3.xx.xx版本还没出来的时候，这个版本限制是没有问题的，但是Cython 3.xx.xx出来后，这里就会拉到3.xx.xx的版本，导致编译出错。

因此，我把版本限制改为如下：

重新打包为h5py-3.1.0-new.tar.gz，我们在安装tensorflow之前提前安装新的h5py包。执行如下命令：

pip install h5py-3.1.0-new.tar.gz

 安装完后再安环tensorbord，完美解决。

4 总结

核心原因就是h5py-3.1.0的setup.py文件对Cython的版本限制不够严谨，只考虑到版本必须大于某个版本的情况。在3.x.x版本没出来之前，没有问题，但是3.x.x版本出来后，由于3.x.x不向下兼容，导致问题发生。