Rlimma包GEO多芯片差异基因分析

在使用Rlimma包进行GEO多芯片差异基因分析时遇到错误:Error in rt[as.vector(diffSig[, 1]), ] : only 0’s may be mixed with negative subscripts。问题出现在合并后的数据,尽管数值小于10,暗示已取对数,但该错误通常与尝试访问负索引或不合法索引位置有关。寻求解决方案。" 71370753,5019913,C++11中std::unique_lock的生产者-消费者模型分析,"['C++', '多线程', '模型', '同步机制', 'std::unique_lock']
摘要由CSDN通过智能技术生成

GEO多芯片差异基因分析时候出现以下错误:Error in rt[as.vector(diffSig[, 1]), ] :
only 0’s may be mixed with negative subscripts。合并了两个数据,数据数值都小于10,应该是已经取了log的。但是为什么会出现这个情况,求大神告知!!!!!!!!

logFoldChange=1
> adjustP=0.05
> 
> library(limma)
> setwd("C:\\Users\\acer\\Desktop\\DEGs\\07.diff")
> rt=read.table("normalize.txt",sep="\t",header=T,check.names=F)
> rt=as.matrix(rt)
> rownames(rt)=rt[,1]
> exp=rt[,2:ncol(rt)]
> dimnames=list(rownames(exp),colnames(exp))
> rt=matrix(as.numeric(as.matrix(exp)),nrow=nrow(exp),dimnames=dimnames)
> 
> #differential
> modType=c(rep("normal",6),rep("Endometrium"
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