R语言安装一些包的一些常见问题及经验之谈的解决办法

R语言解释器自带有一些系统包，对于大多数人来说够用了，但是这些基础包通常不能满足我们的需要，这时候就需要从互联网下载一些第三方或者官方包以满足我们的需要。不光是R语言，包括Python、Java、Php、C++等等，我只能说这些我用过的语言都是这样，都需要下载安装包，来扩展程序的功能。

如果我看得更远一点的话，是因为我站在巨人的肩膀上

——牛顿

牛顿这句话大概就是说，有了前人知识的积累，我直接学会，拿来用，不用自己重新发明创造这些知识、原理了。我在运用这些知识，加上自己的创新，创造、发现基于这些知识、理论的东西。

R语言里面有大量的包，我们需要的时候，只需要一个简单的libray(package-name)即可。我们用R语言的这些包，也是这方面的顶级程序员花时间、动脑筋写出来的，封装好了供我们使用。可能，有一些简单的包的功能，我们自己可以写。

但是，我们不想重复造轮子。

现在在软件开发行业，要么公司内部自己开发一套，后面几乎可以一劳永逸，一直使用，不用大的修改。大部分的软件框架，都是使用别人开发好的，这些开发好的，有开源的，比如基于开源协议的linux、python等等，还有开源组织的apache基金会等等，这些框架都是由世界上有着相同兴趣爱好、顶级程序员开发出来的，其它人，拿来即用即可。

---

啰嗦了这么多，下面进入今天的正题。

package ‘airway’ is not available (for R version 3.1.0)

很多人包括我自己在安装R包的时候都会遇到一些各种各样的问题，很多时候都是熟手无策，通常情况下，这些问题，还是可以尝试一些解决办法的，纯属经验之谈。

结合自己的经验，也在网上找了一些过来人的经验之谈，通常有这么些做法，遇到问题时候，可以按照这个思路去尝试一下。

---

如何查看你已经安装了和可以安装哪些R包？

最近经常出现一个错误，类似于package ‘airway’ is not available (for R version 3.1.0)

就是某些包在R的仓库里面找不到，这个错误非常普遍，stackoverflow上面非常详细的解答：

http://stackoverflow.com/questions/25721884/how-should-i-deal-with-package-xxx-is-not-available-for-r-version-x-y-z-wa

在阅读这个答案的时候，我发现了一个非常有用的函数！available.packages()可以查看自己的机器可以安装哪些包！

R语言里面的包其实是很简单的，因为它自带了一个安装函数install.packages()基本上可以解决大部分问题！

但是如果出问题也是蛮复杂的，因为要考虑的东西很多:

• 首先你的R语言安装在什么机器什么？（linux(ubuntu?centos?),window,mac）

• 其次你的R是什么版本:(3.1 ? 3.2 ?  http://www.bio-info-trainee.com/1307.html )

• 然后你的安装器是什么版本？（主要针对于bioconductor包的安装）

• 然后你的联网方式是什么？https ？http ？

• 最后你选择的R包镜像是什么？

我们首先要知道自己的R包安装到了什么地方?

1> .libPaths()
2[1] "C:/Users/jmzeng/Documents/R/win-library/3.1"
3[2] "C:/Program Files/R/R-3.1.0/library"

这样可以直接进入这些目录去看看有哪些包，每个包都会有一个文件夹！

其次你可以用installed.packages()查看你已经安装了哪些包

最后你可以用available.packages()可以查看自己的机器可以安装哪些包！可以具体到你所安装的包的16个信息！！！

####

ap <- available.packages()

 1> dim(available.packages(contriburl = "https://cran.rstudio.com/bin/windows/contrib/3.2/"))
 2[1] 8110   17
 3> dim(ap)
 4[1] 8155   17
 5> dim(available.packages(contriburl = "http://bioconductor.org/packages/3.1/bioc/bin/windows/contrib/3.2/"))
 6[1] 1000   17
 7> dim(available.packages(contriburl = "http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc//packages/3.1/bioc/bin/windows/contrib/3.2/"))
 8[1] 1000   17
 9用这个参数，可以看不同仓库，甚至不同版本的R包共有哪些资源！！！
10See also Names of R's available packages, ?available.packages.
11Alternatively, the list of available packages can be seen in a browser for 
12CRAN, CRAN (extras), Bioconductor, R-forge and RForge.             

---

问题：如何安装目标包呢？

答：只需要输入命令install.packages("XXX"),就可以下载自己需要的包了，或者从菜单栏里选择安装包--->安装程序包来实现。

问题：使用install.packages("XXX")命令提示错误，检查了若干遍引号和包名称，发现没错的时候，重启了几次R，而R仍是报错的时候，常见的如package ‘xxx’ is not available (for R version 3.0.3)。怎么安装目标包？

答：这时就要选其他方法来装包了。既然R自己一直说出错，那我们自己下载好包再安装总行了吧，可以自己在CRAN上查找目标包，下载zip文件到本地，然后启动R选择本地zip安装就OK了。

问题：我在CRAN上没找到目标包，是什么情况（如功能强大的Rweibo包）？

答：这时候不要急，可能该包在R-forge project 上，上该站查查看吧。

问题：在安装zip包的同时，报错，比如说，提示什么读取错误，文件缺失，不适用等等的问题，那怎么办呢？

答：研究过R包的结构的朋友就会发现，zip文件解压之后就是R中library里的结构。那么，我们可以直接解压zip包，然后将解压后的文件放入R安装根目录的library文件夹里，然后到R命令输入界面library该包试试，是不是成功了呢？

---

问题一：解决Rstudio中安装install.packages("mvtnorm")出现

Warning in install.packages :

  InternetOpenUrl failed: '不能连接到吊销服务器，或者未能获得最终响应。

解决方法使用下面的语句安装：

install.packages("mvtnorm", repos = "http://R-Forge.R-project.org")

问题二：解决Rstudio中安装install.packages("MARSS")出现版本不符合的情况，package ‘MARSS’ is not available (for R version 3.2.5)。

博主使用的R3.2.5版本，原因是这个包已经从cran移除了，你想用的话，就手动下载这个包，然后安装。

需要在http://cran.r-project.org/src/contrib/Archive找到所要安装的包下载。

install.packages("D:\\R_package\\MARSS_3.8.tar.gz",repos=NULL,type="source")

注意：是"\\"分隔，而不能用"\"分隔

猜你可能喜欢