yuxiang&chenxi-CSDN博客

原创 Featurecounts 表达定量得到下游分析的原始数据

featurecounts 表达定量，Linux，转录组上游分析

2022-10-04 21:47:34 1927

原创 Hisat2 比对到参考基因组

hisat2 samtools 转录组上游分析 Linux

2022-10-04 21:34:00 5666

原创 Trim-galore/fastp对数据的过滤

fastp，trimgalore，转录组上游分析，Linux

2022-10-04 20:44:10 2611

原创 FASTQ文件质控

转录组测序上游分析，fastq文件质控，Linux

2022-09-20 10:26:26 1456

原创转录组测序day 1 基础知识

高通量测序、普通转录组的基本知识以及流程

2022-09-20 10:02:21 996

原创单细胞测序的入门操作

单细胞数据的读入、清洗、组间合并和初步的分析

2022-07-24 18:33:45 2949

生信技能树学徒第二周一、GEO数据库芯片数据获取#数据下载rm(list = ls())library(GEOquery)#先去网页确定是否是表达芯片数据，不是的话不能用本流程。以GSE56649为例gse_number = "GSE56649" eSet <- getGEO(gse_number, destdir = '.', getGPL = F)class(eSet)length(eSet)#得出往往是一个长度为一的列表，转换为数据框的格式eSet = eSet[[

2022-05-10 21:02:37 5616 4

原创 GEO数据挖掘（一）基础介绍

GEO数据挖掘，火山图，热图，主成分分析

2022-05-07 16:04:32 17974

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