做微塑料研究如何通过理论计算发表SCI 1区，案例解析

论文简介

标题：Improved microalgae carbon fixation and microplastic sedimentation in the lake through in silico method

作者：Meijin Du b,1 , Qikun Pu b,1 , Yingjie Xu b,1 , Yu Li b , Xixi Li a,c,*

期刊：Science of the Total Environment（ IF：8.1 ）

原文链接：https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2024.171623

研究背景

微塑料(MPs)是一种长期关注的环境问题，它们在淡水环境中的累积速度可能比海洋系统更显著。湖泊生态系统是微塑料的聚集地，也是反映流域功能的指标。湖泊水环境污染日益受到关注，尤其是与海洋污染相比。湖泊水流速较低，可以较长时间地保留水体，从而稳定地积累更多的微塑料。塑料添加剂可以在湖泊环境中持续释放，并对水环境中的微藻产生强烈的毒性影响。作为湖泊水环境的基础生产者，微藻的光合作用不仅是全球碳循环的重要组成部分，也是水生食物链能量流动的起点。微藻具有将碳酸氢盐转运进细胞的能力，因此其碳捕获效率高于陆地植物。因此，有效缓解微塑料对湖泊水环境中微藻碳固定的危害，对发挥微藻的碳固定效果和提高微塑料的去除效果具有双重实际意义。

论文速览

这篇论文旨在通过构建有利于微塑料沉降和微藻碳固定的协同促进机制，缓解微塑料在湖泊水环境中对微藻碳固定的影响。首先，作者设计了不同塑料添加剂配比方案，并通过分子动力学模拟方法评估其对微藻碳固定能力和微塑料沉降能力的影响。结果发现，塑料添加剂的释放会干扰微藻碳固定过程中酶与目标分子的结合，从而降低微藻的碳固定能力。同时，添加剂的释放也不利于微塑料对胞外聚合物的吸附，不利于微藻对微塑料的沉降作用。作者进一步筛选出了4种最佳的塑料添加剂配比方案，并发现阻燃剂DBDPO是主要的有害贡献者。因此，作者基于CiteSpace可视化分析设计了12种DBDPO衍生物，并通过分子动力学模拟分析了其对微藻碳固定和微塑料沉降的影响机制，最终筛选出了两种环境友好的DBDPO替代品。

图文导读

图1. 在不同PE微塑料添加剂配比方案下，微塑料吸附微藻胞外聚合物的能力。

图2. 不同DOE模型中，塑料添加剂的主效应和二阶交互作用的P值(a)和效应估计值(b)。

图3. 过去10年DBDPO替代品分子设计领域的关键词网络图(a)和共被引作者网络图(b)。

图4. DBDPO的分子结构及原子位点示意图。

图5. DBDPO修饰前后RuBisCO CO2吸附的热图(a)以及PRK和核酮糖-5-磷酸结合过程中分子和氨基酸的结合能热图(b)。

图6. 在DBDPO(a)、DBDPO-2(b)和DBDPO-5(c)的影响下，微塑料和胞外聚合物的最终吸附结构图及最短距离图(d)。

试验方法

研究人员使用了分子动力学方法来计算微藻的碳固定性能，包括计算碳酸二氧化物、磷酸甘油酸磷酸、二磷酸甘油酸和核糖醇-5-磷酸分子与不同酶的结合能量。对于微塑料的沉降能力，同样使用了分子动力学方法来计算微塑料在不同PE微塑料添加剂配比方案下对微藻细胞外聚合物的吸附自由能。通过模拟微塑料颗粒与微藻、胞外聚合物的相互作用，他们能够了解添加剂对这些过程的影响。

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创新思路

研究视角方面：这篇论文从微塑料添加剂对微藻碳固定和微塑料沉降的协同影响出发，构建了一种有利于微塑料沉降和微藻碳固定的协同促进机制。这不仅有助于缓解微塑料对湖泊水环境中微藻碳固定的不利影响，也能促进微塑料在水体中的沉降，从而改善整个湖泊生态系统。这种系统性的研究视角是值得肯定的创新点。

研究方法方面：论文采用了分子动力学模拟、分子力学计算、实验设计等多种理论计算和实验方法相结合的研究策略。这不仅能够深入探究微塑料添加剂对微藻和微塑料行为的影响机制，还能够有针对性地设计出环境友好的添加剂替代品。这种多学科交叉的研究方法为解决复杂的环境问题提供了新思路。

分子设计方面：论文利用CiteSpace可视化分析方法，基于文献数据挖掘DBDPO分子修饰的规律，设计出12种新型DBDPO衍生物。这种基于大数据分析的分子设计方法，为开发环境友好型化学品提供了新的切入点。

总结展望

这篇论文从微塑料添加剂对微藻碳固定和微塑料沉降的协同影响出发，系统地探讨了微塑料在湖泊水环境中的复杂作用机制。论文采用了分子模拟、理论计算、实验设计等多种方法，不仅深入分析了不同添加剂配比方案的影响，还设计出了两种环境友好的DBDPO替代品。这为同时促进微藻碳固定和微塑料沉降提供了理论支持。这项研究为进一步解决湖泊水环境中微塑料污染问题提供了新思路。首先，可以进一步探究微塑料对微藻抗氧化系统的影响，并结合碳固定过程，更全面地评估微塑料的生态毒性。其次，可以将这种协同促进机制拓展到其他水生生态系统，如河流和海洋，为全面改善水环境质量提供技术支持。最后，基于大数据分析的分子设计方法也可以应用于其他类型的环境污染物，为开发绿色环保型化学品提供新的研究方向。