emmal_的博客

原创 cytoscape作图难？10分钟搞定OTU的互作网络分析相关性联系图+MENA使用教程！

科研小伙伴们，如果你是从事肠道菌群、微生物组、基因组、蛋白组、代谢组等组学分析，那就离不开一个强大的互作网络绘图软件CYTOSCAPE，安装过程在之前写的文章cytoscape安装及使用-1中已经安利给大家了，不过使用的教程还没完成。今天我想给大家介绍一个联合MENA网站进行相关性分析的cytoscape操作教程，如果想我继续发布其他内容请多多点赞，我看到会很高兴哒！因为自己也很咸鱼，懒散发布文章...

原创 Student's t test、Welch T检验和Wilcoxon秩和检验

Student t检验（Student’s t test），亦称T检验，是用t分布理论来推论差异发生的概率，从而比较两个平均数的差异是否显著，主要用于样本含量较小（例如n<30），总体标准差σ未知的正态分布数据。Welch T检验（Welch’s t test）在两组数目方差不相等时可选择该检验。Wilcoxon秩和检验（Wilcoxon rank-sum test），也叫曼-惠特尼U...

原创 cytoscape安装及使用-1

JAVA：cytoscape的安装使用建立在JAVA的基础上，先安装JAVA8：https://www.java.com/zh_CN/。下载cytoscape，http://cytoscape.org/，建议翻墙下载，若无法下载可留言，提供百度云链接。安装cytoscape时可顺便下载JAVA。...

原创 不用R语言也可以画两矩阵水平上的相关性分析-heatmap（菌群或代谢物与药效的相关性分析）

本文主要通过生信人-SangerBox；EXCEL（2010版以上）和AI三个软件进行绘制Heatmap相关性热图。sangerbox下载地址（免费）：http://sangerbox.com/；sangerbox官网：https://shengxin.ren/，学习软件使用及其他视频教学（部分收费）。相关性分析批量计算：准备数据及表格规范化：横表头为样品编号，纵坐标为环境因子。注意两个...

原创 metaboanalyst-statistic解析-满满干货！

原创 Metabo Analyst使用教程-Pathway Analysis模块

在线免费使用https://www.metaboanalyst.ca/

原创 应届毕业生落户深圳的步骤

落户深圳前先了解自己的实际条件，楼主研究生毕业，户口在大学的时候已经迁到大学所在地，毕业后不在深圳工作，但是想将档案和户口都放在深圳，出于其他考虑。直接贴上操作流程：首先我们要明白深圳的政策安排是档案和户口相关联，缺一不可。进入正题：我们在签署了三方协议后，向“深圳人才”...

原创 MOFLO XDP分选-1原理

原创 一张图告诉你---相关性分析及回归分析

双变量/多变量的关联分析方法：spearman、pearson相关性分析方法的数据特征及回归分析的数据特征类型。

原创 一张图解决统计学疑问---如何选择合适的统计方式

全网最全！一张图囊括所有科研会用到的统计学分析：助力统计学小白！感谢临床科研与meta分析公众号整理的统计学知识。

原创 有序分类和连续变量所对应的相关性

戳戳原链接：https://support.minitab.com/zh-cn/minitab/18/help-and-how-to/modeling-statistics/regression/supporting-topics/basics/what-are-categorical-discrete-and-continuous-variables/。分类变量（categorical var...

原创 如何用perl脚本筛选两个表格中重复项

window搜索-cmd（命令提示符）-输入软件名称-若显示软件版本与编号，则安装成功；若显示失败（没有找到），则安装失败。

原创 AI-染色体绘制

圆角矩形工具-点击中心点设置圆角半径-矩形工具画基因-添加文字；全选-右键-编组-颜色参考-编辑颜色-重新着色画稿-编辑-条件颜色。

原创 公交思考

即将面临毕业季，来广州6年有余，却对市内熟悉程度不够，周末想去搭公交，了解城市交通第一步。享受流动的思考。

原创 AI-画弧形

操作步骤：矩形-效果-变形-弧形-预览并调节。

原创 流式实操-LEGENDplex多因子检测试剂盒与Mojosort磁珠分选

因为是实操课，所以不知道如何记录并写出来，使用仪器为BD FACSVerse，仪器的软件使用有视频，电脑F盘，需要时可以回顾。磁珠分选使用的是Bio Legend的Mojosort磁场，黄色的为磁场，当分选时不能旋转，会打乱磁场。...

原创 AI-画基因元素

按住“Alt”不断复制同样大小的矩形；全选窗口-对齐单击对齐对象，设置对齐间距为10mm点击对齐对象，选择垂直顶对齐，居中对齐，底对齐。加上文字，全选，鼠标右键“编组”，使其成为一个整体。加入圆角矩形，改变锚点，置于底层，完成。...

原创 流式细胞仪培训-零散day2

检测对象：细胞，染色体，微生物，人工合成微球。上样包括正压上样与负压上样，负压上样与LC-MS的上样阀一致，也称蠕动泵。电信号放大部分：PMT为光电倍增管（常用，普通），APD为雪崩二极管，长波长时（＞600nm），激发效率依旧强和稳定。灵敏度：20MESF，MESF Molecules of Equivalent Soluble Fluorochrome各个峰的等量可溶性荧光分子，指流...

原创 流式细胞仪培训记录-零散版day1

流式细胞仪的优势：检测单细胞，高通量。因为高通量所以数据中包含统计学计算。Flow（流动） cyto（细胞） metry（技术）。光谱流式：全光谱流式：事先学习荧光素的光谱特征，不同荧光素都有其独特的光谱特征，有点像人脸识别似的，只不过比人脸识别简单多了。通过这种解析，就智能得消除了常规流式累死人的荧光渗漏影响。在硬件上，光谱流式同时还大大降低了光路的复杂程度，使得仪器成本能够大大降低。常规...

原创 AI-截图

截图：新建一张图片，矩形选择剪裁部分。ctrl+A，全选，鼠标右键创建剪切蒙版。

原创 AI-lesson-1-drawing mice-AI画小鼠

The work直接选择工具，添加/删除锚点工具，椭圆工具，形状生成器工具。首先新建空白画板其次画一大一小椭圆画个矩形，方便“割腿”，全选。选择形状生成器工具，按“alt”，按住 鼠标左键，选择要割掉的部分。成功平割腿也是一样的操作，先画两个椭圆，再利用形状生成器工具“割掉”不喜欢的部分，然后加上鼻子眼睛耳朵和尾巴，添加颜色即可。这节课主要学习“形状生成器工具”的使用。白...

原创 ## STAMP使用中数据上传注意事项

STAMP使用中数据上传注意事项链接(http://kiwi.cs.dal.ca/Software/STAMP)]下载后安装注意安装路径不能有中文。打开软件界面如下：准备数据表格，格式十分关键！需准备2个表格，表格1的内容是原始数据，表格2是metadata，作用是“告诉stamp这个软件，表格1的样品分组情况”.在这里介绍直接用OTU或其他原始数据改spf格式上传的方法：表1...