本文介绍了如何使用Cytoscape结合MENA网站进行OTU的相关性网络分析。首先，提供了MENA网站的链接、注册登录步骤以及上传数据的注意事项。接着，详细讲解了数据计算、网络构建、分析参数设置和结果查看的过程。最后，展示了如何在Cytoscape中导入和优化网络图，以生成更美观的互作网络图。
科研小伙伴们，如果你是从事肠道菌群、微生物组、基因组、蛋白组、代谢组等组学分析，那就离不开一个强大的互作网络绘图软件CYTOSCAPE，安装过程在之前写的文章cytoscape安装及使用-1中已经安利给大家了，不过使用的教程还没完成。今天我想给大家介绍一个联合MENA网站进行相关性分析的cytoscape操作教程，如果想我继续发布其他内容请多多点赞，我看到会很高兴哒！因为自己也很咸鱼，懒散发布文章都是看自己最近学到什么新技巧记录下来，顺便能帮助到各位解决难题。
结果如下：
黄色的圆圈表示OTU，蓝色的线表示负相关的OTU，红色的线表示正相关的OTU。
进入正题：
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在这里抛出MENA网站的链接：[MENA]****(http://ieg4.rccc.ou.edu/mena/)，这个网站免费使用，但有个小小的问题：每个月有几天会打不开（可以耐心多等待几天）。
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