主成分分析的可视化展示

本文介绍了主成分分析(PCA)的基本概念,推荐了R语言中的FactoMineR和factoextra包进行PCA分析与可视化,并通过mtcars数据集展示了碎石图、变量相关图、变量贡献图和主成分样本散点图,揭示了数据的降维结构和关键特征。
摘要由CSDN通过智能技术生成
一、主成分分析简介

    在对于一件事物的研究过程中,为了准确的反映事物间的关系,往往需要收集多维指标,以保证尽可能全面地收集信息。然而多维指标往往会提高分析人员的分析难度,并且相似变量也造成了信息重叠,不利于准确提炼数据关系的本质。

    主成分分析法(PCA)就是一种常见的降维算法,它能够降低数据维度,减少高维数据分析难度。主成分分析法能够在实现降维的同时,能够尽量的保证信息损失。因此在很多分析工作中,可以通过提炼主成分的方式,仅依靠少数几个线性组合代替原先的数据集,既提高了数据分析效率,又避免了数据信息的过多损失。

二、R包介绍

    FactoMineR包是主要用于多元统计分析的R包,它能轻松实现主成分分析、因子分析、聚类分析等多元统计分析方法,并提供对分析结果做可视化的分析工具。factoextra包也是多元统计分析包的主要组件,他主要用于提取多元统计分析结果,并进行可视化探索。本文将基于FactoMineR包和factoextra包进行主成分分析。

FactoMineR包的主要函数:

  • PCA: 用于主成分分析的方法
  • HCPC:层次聚类分析法
  • MCA:多重对应分析
  • MFA:多因素分析
  • FAMD: 混合数据因子分析
  • CA : 对应分析

factoextra包的主要函数:

  • fviz_pca:可视化PCA分析
  • fviz_mca:可视化多重对应分析
  • fv
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