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nnunet
shchojj
这个作者很懒,什么都没留下…
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nnunet 扩充流程
原创 2021-12-17 16:03:36 · 271 阅读 · 0 评论 -
nnunet参数
原创 2021-08-13 14:23:26 · 813 阅读 · 3 评论 -
expected to have finished reduction in the prior iteration before starting a new one
问题出现在多GPU种的DDP训练。两种改法:一、https://blog.csdn.net/weixin_36670529/article/details/106729116即find_unused_parameters=True二、逐层对照网络,将网络中无效的网络层删除。核心问题就是构建的网络中存在实际不参与forward的部分。两种修改方式时间上的差异不是很明显。...转载 2021-06-22 12:34:57 · 2890 阅读 · 0 评论 -
UNetPlusPlus
https://arxiv.org/pdf/1912.05074.pdfhttps://github.com/MrGiovanni/UNetPlusPlus看起来网络变复杂了,实际上就是增加了广度,深度方面可以略微限制,至于实际使用和有效性怎么样还在验证,我是在nnunet分支的网络上修改的,一个是注意计算plans时计算显存消耗,另一个是在构建网络时的pool索引,以及对照deep supervision的loss修改。...原创 2021-06-21 18:59:31 · 898 阅读 · 7 评论 -
nnunet(二十六) postprocessing
注:个人理解,不一定正确。原创 2021-06-07 18:42:09 · 708 阅读 · 0 评论 -
nnunet(二十五) scores
注:个人理解,不一定正确。原创 2021-06-07 18:41:37 · 123 阅读 · 0 评论 -
nnunet(二十四) prediction
注:个人理解,不一定正确。原创 2021-06-07 18:40:55 · 588 阅读 · 0 评论 -
nnunet(二十三) train
注:个人理解,不一定正确。原创 2021-06-07 18:40:08 · 479 阅读 · 0 评论 -
nnunet(二十二) preprocessing
注:个人理解,不一定正确。原创 2021-06-07 18:39:21 · 396 阅读 · 1 评论 -
nnunet(二十一) plan
注:个人理解,不一定正确。原创 2021-06-07 18:38:34 · 386 阅读 · 0 评论 -
nnunet(二十) Dataset_Analyze
注:个人理解,不一定正确。原创 2021-06-07 18:37:25 · 175 阅读 · 0 评论 -
nnunet(十九) dataset_conversion
注:个人理解,不一定正确。原创 2021-06-01 11:24:06 · 223 阅读 · 0 评论 -
基于组合 U-Net 网络的 CT 图像头颈放疗危及器官自动分割
http://jcjs.siat.ac.cn/jcjs/article/pdf/202002003基于组合 U-Net 网络的 CT 图像头颈放疗危及器官自动分割Head and Neck CT Segmentation Based on a Combined U-Net Model翻译 2021-05-07 15:43:21 · 345 阅读 · 5 评论 -
nnunet Unable to allocate array with shape and data type
在进行validation的时候出现Unable to allocate array with shape and data type其主要原因就是swap的大小不足参照:https://blog.csdn.net/sabers_master/article/details/102530357https://juejin.cn/post/6844903751505936397原创 2021-04-30 17:36:30 · 694 阅读 · 1 评论 -
nnunet(十八) dataset_conversion
__init__.py表示该文件夹目录是一个模块(module)from __future__ import absolute_import#引用当前系统环境下的对象,而不是当前文件夹同名的文件from . import *#导入当前文件夹下的所有文件Task017_BeyondCranialVaultAbdominalOrganSegmentation.py# Copyright 2020 Division of Medical Image Computing, German转载 2021-04-19 11:37:26 · 687 阅读 · 0 评论 -
nnunet(十七) nnUNet_convert_decathlon_task
from __future__ import absolute_import即先在本目录下寻找模块。但是如果本目录中有模块名与系统(sys.path)模块同名冲突,而想要引用的是系统模块时,该声明就能够起作用了。__init__.py可以使得当前目录变成module package...转载 2021-04-09 16:51:53 · 2067 阅读 · 0 评论