Caffe源码中io文件分析

Caffe源码(caffe version commit: 09868ac , date: 2015.08.15)中有一些重要的头文件，这里介绍下include/caffe/util/io.hpp文件的内容：

1.      include文件：

(1)、<google/protobuf/message.h>：关于protobuf的介绍可以参考：http://blog.csdn.net/fengbingchun/article/details/49977903

(2)、<caffe/blob.hpp>：此文件的介绍可以参考：http://blog.csdn.net/fengbingchun/article/details/59106613

(3)、<caffe/common.hpp>：此文件的介绍可以参考：http://blog.csdn.net/fengbingchun/article/details/54955236

(4)、<caffe/proto/caffe.pb.h>：此文件的介绍可以参考：http://blog.csdn.net/fengbingchun/article/details/55267162

2.      <mkstemp.h>文件：

此文件是来自于libc/sysdeps/posix/tempname.c，此文件中包含一个静态全局常量letters和一个基于TMPL生成临时文件名的函数mkstemp。此文件在源码中没有用到，仅在test文件中用到。此文件仅在Linux下使用，在Windows下直接使用会有问题，而且在新版的Caffe中，已将此文件移除。

3.      函数：

此文件中的函数主要作用包括：读取prototxt文本文件并解析(反序列化)；生成prototxt文本文件即序列化；读取caffemodel二进制文件并解析(反序列化)；生成caffemodel二进制文件即序列化；读取二进制文件、图像文件到Datum类；对Datum进行解码；将图像读取到cv::Mat；解码Datum到cv::Mat；将cv::Mat转换为Datum。

Datum既可以直接存储解码前的数据，也可以存储解码后的数据。Datum支持两种数据类型string和float。

<caffe/util/io.hpp>文件的详细介绍如下：

#ifndef CAFFE_UTIL_IO_H_
#define CAFFE_UTIL_IO_H_

#include <unistd.h>
#include <string>
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <string.h>
#include <errno.h>

#include "google/protobuf/message.h"

#include "caffe/blob.hpp"
#include "caffe/common.hpp"
#include "caffe/proto/caffe.pb.h"

#include "mkstemp.h"

namespace caffe {

using ::google::protobuf::Message;

// 生成临时文件，在windows下不能直接调用此文件
// 此函数在新版的Caffe中，在windows下可以直接调用
inline void MakeTempFilename(string* temp_filename) {
  temp_filename->clear();
  *temp_filename = "/tmp/caffe_test.XXXXXX";
  char* temp_filename_cstr = new char[temp_filename->size() + 1];
  // NOLINT_NEXT_LINE(runtime/printf)
  strcpy(temp_filename_cstr, temp_filename->c_str());
  int fd = mkstemp(temp_filename_cstr);
  CHECK_GE(fd, 0) << "Failed to open a temporary file at: " << *temp_filename;
#ifndef _MSC_VER
  close(fd);
#else
  _close(fd);
#endif
  *temp_filename = temp_filename_cstr;
  delete[] temp_filename_cstr;
}

// 生成临时目录，在windows下不能直接调用此文件
// 此函数在新版的Caffe中，在windows下可以直接调用
inline void MakeTempDir(string* temp_dirname) {
  temp_dirname->clear();
  *temp_dirname = "/tmp/caffe_test.XXXXXX";
  char* temp_dirname_cstr = new char[temp_dirname->size() + 1];
  // NOLINT_NEXT_LINE(runtime/printf)
  strcpy(temp_dirname_cstr, temp_dirname->c_str());
  //char* mkdtemp_result = mkdtemp(temp_dirname_cstr);
#ifndef _MSC_VER 
  char* mkdtemp_result = mkdtemp(temp_dirname_cstr);
#else
  errno_t mkdtemp_result = _mktemp_s(temp_dirname_cstr, sizeof(temp_dirname_cstr));
#endif
  CHECK(mkdtemp_result != NULL)
      << "Failed to create a temporary directory at: " << *temp_dirname;
  *temp_dirname = temp_dirname_cstr;
  delete[] temp_dirname_cstr;
}

// 读取prototxt文本文件并解析(反序列化)
bool ReadProtoFromTextFile(const char* filename, Message* proto);
// 读取prototxt文本文件并解析(反序列化)
inline bool ReadProtoFromTextFile(const string& filename, Message* proto) {
  return ReadProtoFromTextFile(filename.c_str(), proto);
}
// 读取prototxt文本文件并解析(反序列化)
inline void ReadProtoFromTextFileOrDie(const char* filename, Message* proto) {
  CHECK(ReadProtoFromTextFile(filename, proto));
}
// 读取prototxt文本文件并解析(反序列化)
inline void ReadProtoFromTextFileOrDie(const string& filename, Message* proto) {
  ReadProtoFromTextFileOrDie(filename.c_str(), proto);
}

// 生成prototxt文本文件，即序列化
void WriteProtoToTextFile(const Message& proto, const char* filename);
// 生成prototxt文本文件，即序列化
inline void WriteProtoToTextFile(const Message& proto, const string& filename) {
  WriteProtoToTextFile(proto, filename.c_str());
}

// 读取caffemodel二进制文件并解析(反序列化)
bool ReadProtoFromBinaryFile(const char* filename, Message* proto);
// 读取caffemodel二进制文件并解析(反序列化)
inline bool ReadProtoFromBinaryFile(const string& filename, Message* proto) {
  return ReadProtoFromBinaryFile(filename.c_str(), proto);
}
// 读取caffemodel二进制文件并解析(反序列化)
inline void ReadProtoFromBinaryFileOrDie(const char* filename, Message* proto) {
  CHECK(ReadProtoFromBinaryFile(filename, proto));
}
// 读取caffemodel二进制文件并解析(反序列化)
inline void ReadProtoFromBinaryFileOrDie(const string& filename, Message* proto) {
  ReadProtoFromBinaryFileOrDie(filename.c_str(), proto);
}

// 生成caffemodel二进制文件，即序列化
void WriteProtoToBinaryFile(const Message& proto, const char* filename);
// 生成caffemodel二进制文件，即序列化
inline void WriteProtoToBinaryFile(const Message& proto, const string& filename) {
  WriteProtoToBinaryFile(proto, filename.c_str());
}

// 注：以下的Datum是定义在caffe.proto中的一个message，其字段有channels、height、width、data、label、float_data、encoded
// 读取二进制数据文件到Datum类
bool ReadFileToDatum(const string& filename, const int label, Datum* datum);
// 读取二进制数据文件到Datum类
inline bool ReadFileToDatum(const string& filename, Datum* datum) {
  return ReadFileToDatum(filename, -1, datum);
}

// 读取图像文件到Datum类
bool ReadImageToDatum(const string& filename, const int label,
    const int height, const int width, const bool is_color,
    const std::string & encoding, Datum* datum);
// 读取图像文件到Datum类
inline bool ReadImageToDatum(const string& filename, const int label,
    const int height, const int width, const bool is_color, Datum* datum) {
  return ReadImageToDatum(filename, label, height, width, is_color,
                          "", datum);
}
// 读取图像文件到Datum类
inline bool ReadImageToDatum(const string& filename, const int label,
    const int height, const int width, Datum* datum) {
  return ReadImageToDatum(filename, label, height, width, true, datum);
}
// 读取图像文件到Datum类
inline bool ReadImageToDatum(const string& filename, const int label,
    const bool is_color, Datum* datum) {
  return ReadImageToDatum(filename, label, 0, 0, is_color, datum);
}
// 读取图像文件到Datum类
inline bool ReadImageToDatum(const string& filename, const int label, Datum* datum) {
  return ReadImageToDatum(filename, label, 0, 0, true, datum);
}
// 读取图像文件到Datum类
inline bool ReadImageToDatum(const string& filename, const int label,
    const std::string & encoding, Datum* datum) {
  return ReadImageToDatum(filename, label, 0, 0, true, encoding, datum);
}

// 对Datum进行解码
bool DecodeDatumNative(Datum* datum);
// 对Datum进行解码
bool DecodeDatum(Datum* datum, bool is_color);

// 将图像读取到cv::Mat(可选择读取灰度图还是彩色图、可进行图像缩放操作)
cv::Mat ReadImageToCVMat(const string& filename,
    const int height, const int width, const bool is_color);
// 将图像读取到cv::Mat
cv::Mat ReadImageToCVMat(const string& filename,
    const int height, const int width);
// 将图像读取到cv::Mat
cv::Mat ReadImageToCVMat(const string& filename,
    const bool is_color);
// 将图像读取到cv::Mat
cv::Mat ReadImageToCVMat(const string& filename);

// 解码Datum到cv::Mat
cv::Mat DecodeDatumToCVMatNative(const Datum& datum);
// 解码Datum到cv::Mat
cv::Mat DecodeDatumToCVMat(const Datum& datum, bool is_color);

// 将cv::Mat转换为Datum
void CVMatToDatum(const cv::Mat& cv_img, Datum* datum);

}  // namespace caffe

#endif   // CAFFE_UTIL_IO_H_

在caffe.proto文件中，有一个message是与io相关的，如下：

message Datum { // 存储图像数据，可以解码前的即编码，也可以是解码后的
  optional int32 channels = 1; // 图像通道数
  optional int32 height = 2; // 图像高
  optional int32 width = 3; // 图像宽
  // the actual image data, in bytes
  optional bytes data = 4; // 以std::string类型存储图像数据
  optional int32 label = 5; // 当前图像对应的label值
  // Optionally, the datum could also hold float data.
  repeated float float_data = 6; // 以float类型存储图像数据
  // If true data contains an encoded image that need to be decoded
  optional bool encoded = 7 [default = false]; // 是否是编码数据
}

io的测试代码如下：

#include "funset.hpp"
#include <string>
#include <vector>
#include "common.hpp"

static bool ReadImageToDatumReference(const std::string& filename, const int label,
	const int height, const int width, const bool is_color, caffe::Datum* datum)
{
	cv::Mat cv_img;
	int cv_read_flag = (is_color ? CV_LOAD_IMAGE_COLOR : CV_LOAD_IMAGE_GRAYSCALE);

	cv::Mat cv_img_origin = cv::imread(filename, cv_read_flag);
	if (!cv_img_origin.data) {
		fprintf(stderr, "Could not open or find file: %s\n", filename.c_str());
		return false;
	}
	if (height > 0 && width > 0)
		cv::resize(cv_img_origin, cv_img, cv::Size(width, height));
	else
		cv_img = cv_img_origin;


	int num_channels = (is_color ? 3 : 1);
	datum->set_channels(num_channels);
	datum->set_height(cv_img.rows);
	datum->set_width(cv_img.cols);
	datum->set_label(label);
	datum->clear_data();
	datum->clear_float_data();
	std::string* datum_string = datum->mutable_data();

	if (is_color) {
		for (int c = 0; c < num_channels; ++c) {
			for (int h = 0; h < cv_img.rows; ++h) {
				for (int w = 0; w < cv_img.cols; ++w) {
					datum_string->push_back(static_cast<char>(cv_img.at<cv::Vec3b>(h, w)[c]));
				}
			}
		}
	} else {  // Faster than repeatedly testing is_color for each pixel w/i loop
		for (int h = 0; h < cv_img.rows; ++h) {
			for (int w = 0; w < cv_img.cols; ++w) {
				datum_string->push_back(static_cast<char>(cv_img.at<uchar>(h, w)));
			}
		}
	}

	return true;
}

static int CompareDatumMat(const caffe::Datum& datum1, const caffe::Datum& datum2)
{
	if (datum1.channels() != datum2.channels() || datum1.height() != datum2.height() ||
		datum1.width() != datum2.width() || datum1.data().size() != datum2.data().size()) {
		fprintf(stderr, "these values should be equal\n");
		return -1;
	}

	const std::string& data1 = datum1.data();
	const std::string& data2 = datum2.data();
	for (int i = 0; i < datum1.data().size(); ++i) {
		if (data1[i] != data2[i]) {
			fprintf(stderr, "their data should be equal\n");
			return -1;
		}
	}

	return 0;
}

static int CompareDatumMat(const caffe::Datum& datum, const cv::Mat& mat)
{
	if (datum.channels() != mat.channels() || datum.height() != mat.rows || datum.width() != mat.cols) {
		fprintf(stderr, "these values should be equal\n");
		return -1;
	}

	const std::string& datum_data = datum.data();
	int index = 0;
	for (int c = 0; c < mat.channels(); ++c) {
		for (int h = 0; h < mat.rows; ++h) {
			for (int w = 0; w < mat.cols; ++w) {
				if (datum_data[index++] != static_cast<char>(mat.at<cv::Vec3b>(h, w)[c])) {
					fprintf(stderr, "their data should be equal\n");
					return -1;
				}
			}
		}
	}

	return 0;
}

static int CompareDatumMat(const cv::Mat& mat1, const cv::Mat& mat2)
{
	if (mat1.channels() != mat2.channels() || mat1.rows != mat2.rows || mat1.cols != mat2.cols) {
		fprintf(stderr, "these values should be equal\n");
		return -1;
	}

	for (int c = 0; c < mat1.channels(); ++c) {
		for (int h = 0; h < mat1.rows; ++h) {
			for (int w = 0; w < mat1.cols; ++w) {
				if (mat1.at<cv::Vec3b>(h, w)[c] != mat2.at<cv::Vec3b>(h, w)[c]) {
					fprintf(stderr, "their data should be equal\n");
					return -1;
				}
			}
		}
	}

	return 0;
}

int test_caffe_util_io()
{
	std::string filename{ "E:/GitCode/Caffe_Test/test_data/images/a.jpg" };

	// 1. caffe::ReadImageToDatum
	caffe::Datum datum1;
	caffe::ReadImageToDatum(filename, 0, &datum1);
	fprintf(stderr, "datum1: channels: %d, height: %d, width: %d\n",
		datum1.channels(), datum1.height(), datum1.width());

	// 2. test ReadImageToDatumReference
	caffe::Datum datum2, datum_ref2;
	caffe::ReadImageToDatum(filename, 0, 0, 0, true, &datum2);
	ReadImageToDatumReference(filename, 0, 0, 0, true, &datum_ref2);
	if(CompareDatumMat(datum2, datum_ref2) != 0) return -1;

	// 3. test ReadImageToDatumReferenceResized
	caffe::Datum datum3, datum_ref3;
	caffe::ReadImageToDatum(filename, 0, 100, 200, true, &datum3);
	ReadImageToDatumReference(filename, 0, 100, 200, true, &datum_ref3);
	if (CompareDatumMat(datum3, datum_ref3) != 0) return -1;

	// 4. test ReadImageToDatumContent
	caffe::Datum datum4;
	caffe::ReadImageToDatum(filename, 0, &datum4);
	cv::Mat cv_img = caffe::ReadImageToCVMat(filename);
	if (CompareDatumMat(datum4, cv_img) != 0) return -1;

	// 5. test CVMatToDatumContent
	cv_img = caffe::ReadImageToCVMat(filename);
	caffe::Datum datum5;
	caffe::CVMatToDatum(cv_img, &datum5);
	caffe::Datum datum_ref5;
	caffe::ReadImageToDatum(filename, 0, &datum_ref5);
	if (CompareDatumMat(datum5, datum_ref5) != 0) return -1;

	// 6. test ReadFileToDatum
	caffe::Datum datum6;
	if (!caffe::ReadFileToDatum(filename, &datum6)) {
		fprintf(stderr, "read file to datum fail\n");
		return -1;
	}
	fprintf(stderr, "datum encoded: %d; datum label: %d, datum size: %d\n",
		datum6.encoded(), datum6.label(), datum6.data().size());

	// 7. test DecodeDatum
	caffe::Datum datum7;
	caffe::ReadFileToDatum(filename, &datum7);
	if (!caffe::DecodeDatum(&datum7, true)) return -1;
	if(caffe::DecodeDatum(&datum7, true)) return -1;

	caffe::Datum datum_ref7;
	ReadImageToDatumReference(filename, 0, 0, 0, true, &datum_ref7);
	if (CompareDatumMat(datum7, datum_ref7) != 0) return -1;

	// 8. test DecodeDatumToCVMatContent
	caffe::Datum datum8;
	if (!caffe::ReadImageToDatum(filename, 0, std::string("jpg"), &datum8)) return -1;
	cv::Mat cv_img8 = caffe::DecodeDatumToCVMat(datum8, true);
	cv::Mat cv_img_ref = caffe::ReadImageToCVMat(filename);
	// if (CompareDatumMat(cv_img8, cv_img_ref) != 0) return -1; // Note: some values are not equal

	// 9. read prototxt and parse
	std::string solver_prototxt{ "E:/GitCode/Caffe_Test/test_data/model/mnist/lenet_solver.prototxt" };

	caffe::SolverParameter solver_param;
	if (!caffe::ReadProtoFromTextFile(solver_prototxt.c_str(), &solver_param)) {
		fprintf(stderr, "parse solver.prototxt fail\n");
		return -1;
	}

	// 10. write prototxt to text file
	std::string save_prototxt{"E:/GitCode/Caffe_Test/test_data/test.prototxt"};
	caffe::WriteProtoToTextFile(solver_param, save_prototxt);

	return 0;
}

测试结果如下：

生成的test.prototxt文件结果如下：

GitHub： https://github.com/fengbingchun/Caffe_Test