图像处理
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adam_gl
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生物图像处理软件_图像配准
BigWarpCMTKBUnwarpJ (https://imagej.net/BUnwarpJ)ITKElastixSimpleElastixANTs原创 2020-09-19 17:05:03 · 778 阅读 · 0 评论 -
生物图像处理软件_细胞追踪
trackmate原创 2020-09-19 17:03:38 · 1070 阅读 · 0 评论 -
生物图像处理软件汇总(持续更新)
前言成像(imaging)是生物学研究的常用手段之一。然而,对于生物学研究者,如何分析成像后的图像数据是一个普遍的难题。对此,前人已经开发了许多生物图像处理软件。本文试图总结它们的特点,方便研究人员根据自己的研究目的、图像类型和系统配置,选择合适的生物图像处理软件。1. 胞体分割(cell segmentation)胞体识别是生物图像分析中很重要的一步。通常,用于胞体分割的图像是2D或者3...原创 2019-02-16 20:33:12 · 3354 阅读 · 0 评论 -
生物图像处理软件_细胞分割
minsilastik原创 2020-09-19 17:01:21 · 3134 阅读 · 0 评论 -
Matlab图像处理-连通域分析
连通域分析(connected component analysis)的目的是在二值图像中,利用像素之间的连接关系,获得分割不同的区域。详细解释,参见wiki下面是two-pass方法的Matlab实现:image = [0,0,1,0,0,1,0; 1,1,1,0,1,1,1; 0,0,1,0,0,1,0; 0,1,1,0,1,1,0]...原创 2020-03-16 23:30:26 · 2688 阅读 · 0 评论 -
图像处理-尺度空间理论
Hessian矩阵的定义直观理解在图像处理中的应用,检测corner, flat, sheet …原创 2020-03-14 11:19:14 · 705 阅读 · 2 评论 -
Chan-Vese 模型在提取小鼠大脑轮廓中的应用
利用Matlab自带activecontour函数实现图像分割。图中,蓝色曲线是初始化边界,红色曲线是迭代2000次后的计算结果。原创 2019-09-22 14:48:19 · 897 阅读 · 0 评论 -
有限差分法在最优化问题中的应用
通常情况下,图像处理或者计算机视觉中涉及到的最优化问题都有一个共同的特点:目标函数(objective)没有解析形式(analytical form)。也就是说,目标函数没有一个明确的函数表达式,我们不能直接解析地获得目标函数的导数或者偏导数。在这个情况下,我们一般使用有限差分来估计目标函数的导数。这个主题包含两篇文章有限差分法的简单应用 (本文)有限差分法在图像配准最优化中的应用本文...原创 2019-02-26 16:20:40 · 1991 阅读 · 0 评论 -
Maltab 保存32位的tiff图像
Matlab支持对多幅TIFF图像的写入(write),但是,不支持32位的操作。换句话说,如果运行下面的代码:imwrite(uint32(data), 'test.tif');那么程序会报错:Error using writetif (line 92)Writing uint32 image data to a TIFF file is not supported with ...原创 2018-07-12 15:53:32 · 3449 阅读 · 4 评论 -
双线性差值 Matlab代码
首先声明,文章内容非原创,转自 https://stackoverflow.com/questions/26142288/resize-an-image-with-bilinear-interpolation-without-imresizefunction [out] = bilinearInterpolation(im, out_dims) %// Get some nece...转载 2018-06-12 15:21:56 · 1195 阅读 · 0 评论 -
利用互相关方法校正二维图像移动
在对同一个物体进行长时间拍摄的过程中,难免会因为一些外界原因,比如,物体的移动,导致拍摄的物体在成像平面中发生移动。这时,在分析某一特定区域长时间的特性之前,要对成像得到的图像进行校正。本文中针对二维图像水平和竖直方向移动进行校正。校正的方法有很多种,有的是通过搜索、迭代、优化,找到最优解的。而本文中采用了利用互相关的方法,可以做到在一定假设的条件下,直接得到x、y平移的数值。1 互相关用于图像配准原创 2017-04-11 19:53:46 · 8113 阅读 · 12 评论