生物图像处理软件_细胞追踪

最新推荐文章于 2024-03-15 09:53:55 发布
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分类专栏： 图像处理
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通常情况下，成像的图像数据是静态的，也就是说是在某一个时间点的图像。但是，根据研究目的的不同，有时会产生不同时间点的图像，也就是动态图像（2D+T和3D+T）。例如，在双光子成像中，在同一层面，拍摄10分钟后得到的图像数据，就是2D+T的数据格式。同样的，如果每个4小时，对某一个脑区的神经元进行3D成像，那么得到的图像就是3D+T的数据格式。

这里列出的软件主要针对3D+T数据格式的图像，因为2D+T的图像一般是在段时间内获取的，另外，镜头和样品位置相对不变，不存在细胞追踪的问题。对于2D+T的图像

GIF动图来自https://imagej.net/TrackMate
在这里插入图片描述

1 目的

（1）分析不同时间点下，细胞的荧光亮度的变化规律
（2）分析胞体位置随着时间的变化规律

2 软件

名称主页适用图像类型系统要求
TrackMatehttps://imagej.net/TrackMate3D+T无，Fiji插件
  • Cell Tracker
    http://www.celltracker.website/index.html
adam_gl
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