基于R软件的网状meta分析

完整课程代码请关注微信公众号【橙子数据军团】,并回复“网状meta”获取。
首先介绍网状meta的基础知识:

【网状meta】基于R软件的贝叶斯网状meta分析


一、贝叶斯网状meta

※优势在于可以利用后验概率对所有分析的干预的干预措施进行排序,且克服了频率学法在参数估计时通过不断的迭代去估计最大似然函数、易出现不稳定而得到有偏倚的结果的缺陷,故估计值更为准备,且建模更灵活,为当前所推荐的方法

二、NMA分析步骤

1.绘制Network证据图

2.传统Meta分析(直接比较)

3.NMA分析(整合直接比较和间接比较)

4.绘制积累概率排序图

5.三个关键假定的检验与探讨

6.发表偏倚、质量评价、敏感度分析、亚组分析

三、软件安装准备

1.R 安装地址:

R:https://www.r-project.org/

RStudio:https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/

2.chromeinstall

3.GeMTC软件

4.ADDIS软件

四、下面介绍R软件的使用

授之以🐟,不如授之以渔

【网状meta】基于R软件的贝叶斯网状meta分析

五、相关代码演示(完整内容公众号内回复"网状meta")

###加载安装包
library("gemtc")

###读取数据
data <- read.csv("XX.csv", sep=",", header=T) 

###将数据转换成gemtc的网络格式
network <- mtc.network(data)

###网状图
plot(network)

###模型构建阶段(一致性模型)
model <-mtc.model(network, type="consistency", 
                  n.chain=4,likelihood="normal",link="identity",linearModel="random")
#迭代操作
results <- mtc.run(model, n.adapt = 20000, n.iter = 50000, thin = 1)
#输出结果
summary(results)
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R语言是一种用于数据分析和统计建模的编程语言,它提供了丰富的工具和包来进行各种类型的统计分析,包括网状meta分析网状meta分析是一种用于整合具有不同类型和结构的独立研究结果的方法。下面我将详细介绍如何使用R语言进行网状meta分析。 首先,我们需要准备数据。通常,网状meta分析的数据包含每个独立研究的效应估计值和其标准误差。可以使用R语言中的数据框来存储这些数据。 接下来,我们将使用R语言中的`netmeta`包来进行网状meta分析。首先,我们需要安装和加载该包。可以使用以下命令完成: ```R install.packages("netmeta") library(netmeta) ``` 然后,我们需要将数据转换为`netmeta`包可接受的格式。可以使用`netmeta::netmeta_prep()`函数来完成。该函数可将数据转换为`netmeta`包内部的数据结构。 ```R data <- netmeta::netmeta_prep(data) ``` 接下来,我们使用`netmeta::netmeta()`函数来进行网状meta分析。该函数的参数包括数据对象、效应尺度和模型类型等。我们可以通过以下命令运行网状meta分析: ```R result <- netmeta::netmeta(data, measure = "RR", model = "NET") ``` 网状meta分析会返回一个结果对象,其中包括了各研究的效应估计值、标准误差、置信区间以及总体效应估计值和置信区间等。 最后,我们可以使用`netmeta::forest()`函数或`netmeta::net_heatmap()`函数等绘图函数来可视化网状meta分析的结果。这些函数可以生成森林图或热图,以帮助我们更好地理解和解释分析结果。 总而言之,使用R语言进行网状meta分析可以通过安装和加载`netmeta`包,并通过调用相应的函数来完成。这样我们就可以方便地整合独立研究结果以及进行相关的统计分析和可视化了。
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