第一章:biopython
第一节:biopython的安装
1,方法来源
biopython的方法来源:http://biopyhton.org/wiki/Biopython (biopython官网)
文件教程:http://biopython.org/DIST/docs/tutorial/Tutorial.pdf
Get help Tutorial(PDF)
2,不同平台的安装方式
windows平台
登录biopython官网,点击Download Biopython
在Current Release - 1.70-10 July 2017处说明biopython的版本信息
1,进入PyPI官网(https://pypi.python.org/pypi)的search处输入biopython,在Package处点击下载biopython 1.70,将安装包放在python2.7的安装目录下,路径为 C:\Python\Lib\site-packages\ 并解压安装包
2,在电脑桌面开始处点击运行,输入cmd进入doc命令界面,输入cd C:\Python\Lib\site-packages\biopython-1.70
3,之后输入命令 python setuo.py install 进行安装
4,安装包的使用:打开python的Shell界面(python在windows下安装的界面,IDLE (Python GUI)),点击File Open…进入C:\Python\Lib\site-packages\biopython-1.70后打开setup.py,按F5键运行,之后页面显示RESTART: C:\Python\Lib\site-packages\biopython-1.70\setup.py
5,在Shell页面输入import Bio,如果没有报错表示可以使用
linux平台
简单的方法是python2可以使用 pip install 的方法进行安装,输入:pip install biopython -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple/
安装后在Linux的python的交互模式下输入import Bio,如果没有报错表示可以使用