Nextflow 项目使用教程
nextflowA DSL for data-driven computational pipelines项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/ne/nextflow
1. 项目的目录结构及介绍
Nextflow 项目的目录结构如下:
nextflow/
├── bin/
│ ├── nextflow
│ └── nextflow.bat
├── docs/
├── modules/
├── plugins/
├── scripts/
├── src/
├── CHANGELOG.md
├── CODE_OF_CONDUCT.md
├── CONTRIBUTING.md
├── LICENSE
├── README.md
├── build.gradle
├── gradle.properties
├── settings.gradle
目录结构介绍
- bin/: 包含 Nextflow 的可执行文件,包括适用于 Unix 系统的
nextflow
和适用于 Windows 系统的nextflow.bat
。 - docs/: 包含项目的文档文件。
- modules/: 包含 Nextflow 的模块文件。
- plugins/: 包含 Nextflow 的插件文件。
- scripts/: 包含一些辅助脚本。
- src/: 包含项目的源代码。
- CHANGELOG.md: 项目的更新日志。
- CODE_OF_CONDUCT.md: 项目的行为准则。
- CONTRIBUTING.md: 贡献指南。
- LICENSE: 项目的许可证文件。
- README.md: 项目的介绍文档。
- build.gradle: Gradle 构建配置文件。
- gradle.properties: Gradle 属性配置文件。
- settings.gradle: Gradle 项目设置文件。
2. 项目的启动文件介绍
Nextflow 项目的启动文件位于 bin/
目录下,主要包括:
- nextflow: 适用于 Unix 系统的可执行文件。
- nextflow.bat: 适用于 Windows 系统的可执行文件。
这两个文件是 Nextflow 的核心启动文件,用户可以通过运行这些文件来启动 Nextflow 命令行工具。
3. 项目的配置文件介绍
Nextflow 项目的配置文件主要包括:
- build.gradle: Gradle 构建配置文件,定义了项目的构建任务和依赖。
- gradle.properties: Gradle 属性配置文件,包含了一些 Gradle 构建过程中的属性设置。
- settings.gradle: Gradle 项目设置文件,定义了项目的模块和仓库配置。
这些配置文件是 Nextflow 项目构建和运行的重要组成部分,用户可以根据需要修改这些文件来定制项目的构建和运行行为。
nextflowA DSL for data-driven computational pipelines项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/ne/nextflow