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RSS订阅原创 未完成_RFdiffusion应用案例_从头设计pMHC的结合剂
MHC-I 将胞内抗原肽递呈在细胞表面，用于免疫监视。特异性靶向这些 pMHC 复合物可在治疗疾病方面发挥巨大作用。这种靶向的难点需要读出少数朝外的肽残基，并避免与几乎存在于所有细胞上的 MHC 发生广泛接触。本文介绍了如何利用基于DL的蛋白质设计工具，从头开始设计出能在 pMHC 复合物的肽结合槽上方呈现弧形并与肽广泛接触的小蛋白质。研究鉴定了10个 pMHC 靶标的特异性结合剂，它们在酵母展示实验中能与 pMHC 四聚体结合，但不能与密切相关的肽结合。
2024-12-07 23:09:28
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原创 JavaScript_02_notes
是按照顺序反复多次执行一段程序，通常会有明确的终止条件。和。使用这两个特性，能够更清晰、高效、方便地实现迭代。指任何实现的对象。每个迭代器都会关联一个，而迭代器会暴露该对象的 API。迭代器无须了解该对象的结构，只需要知道如何取得连续的值。结构拥有在一个函数块内暂停和恢复代码执行的能力。其形式是一个函数，在函数名称前面加一个星号（ *）表示。调用生成器函数会产生一个，它一开始处于暂停执行（suspended）的状态。调用next()方法会让生成器开始或恢复执行。yield。
2024-02-18 10:39:51
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原创 使用Pipeline和ColumnTransformer提升机器学习代码质量
机器学习项目中最冗长的步骤通常是数据清洗和预处理，库中的Pipeline和 and通过一次封装替代逐步运行transformation步骤，从而减少冗余代码量。
2024-01-09 22:49:30
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原创 深度学习中氨基酸序列的编码方法
随着AI算法创新和算力提升，叠加生物（组学）数据（指数级）增长，深度学习在生信领域中的应用也愈加广泛。具体到蛋白领域，深度学习已经在三级结构预测、新抗原预测等场景中取得了当前最优的预测性能。在实际应用时，为了将氨基酸序列输入深度学习模型，需要通过编码方法将其转化为数字表示。本文介绍了几种常见的编码方法。
2024-01-02 08:01:22
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原创 MaxQuant的安装和使用（linux OR windows）
MaxQuant 是一款定量蛋白质组学软件包，支持多种标记定量和无标定量的质谱数据。
2023-10-30 11:27:24
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原创 【work around】可执行文件（编译时）glibc版本小于运行环境（运行时）glibc版本
可执行文件中GLIBC版本大于运行环境的work around。
2023-10-16 14:17:38
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原创 Nextflow的基本概念和使用方法
基本概念channel用于连接process。process构成流程的基本单元，可以包括directives, inputs, outputs, when clause, script等五部分，语法如下：process < name > { [ directives ] input: <input qualifier> <input name> [from <source channel>] [attributes]
2022-04-30 20:13:45
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原创 Gitlab简介
使用gitlab常用命令https://www.cnblogs.com/ray-mmss/p/10861703.htmlgitlab之一: gitlab安装配置使用https://www.cnblogs.com/yitianyouyitian/p/9214940.htmlGitlab磁盘空间问题 针对Prometheushttps://blog.csdn.net/johnchensz/article/details/106414335Monitoring GitLab with Prometh
2021-07-12 23:10:47
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原创 [摘录] 使用linux搭建流程的一些技术细节
set 命令参数作用set -e若指令传回值不等于0，则立即退出shell。set -o pipelineset -x执行指令后，会先显示该指令及所其参数。set -u当执行时使用到未定义变量，则显示错误信息。# 写法1set -euxo pipefail# 写法2bash -euxo pipefail script.shLinux set命令Bash 脚本 set 命令教程Bash 错误处理如果脚本里面有运行失败的命令（返回值非0），
2021-06-28 21:40:50
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原创 C语言学习笔记--基本概念
1. 安装安装：集成开发环境（IDE）：集成开发的各个部分（编辑、编译、链接、执行、调试等）的软件包。2. Hello world示例代码1：pun.c/* * Name: pun.c * Author: K. N. King, Rys */# include <stdio.h> /* header: <stdio.h> */int main (void) /*int: 函数将返回一个整数值; void: 函数没有参数*/{ printf(
2021-06-12 10:50:22
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原创 html 入门
Header 1A paragraph.<html> <head> </head> <body> </body></html>head标签描述style1) 定义样式信息. 2) type=“text/css” 定义 style 元素的内容,body标签描述...
2021-05-24 23:00:38
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netMHCpan-4.1b.Linux.tar.gz
2023-10-12
空空如也
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